25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4436 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 219 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  59.52 
 
 		 220 aa  238  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  59.81 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  61.5 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  59.09 
 
 		 213 aa  228  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  45.5 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.67 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3360  hypothetical protein  34.97 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3600  bifunctional DNA primase/polymerase  35.48 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514874 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.43 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.57 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  29.35 
 
 		 717 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  40 
 
 		 717 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35850  hypothetical protein  26.42 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109111  normal  0.177404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  36.47 
 
 		 266 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  30.1 
 
 		 746 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  37.65 
 
 		 717 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  37.21 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  35.71 
 
 		 263 aa  48.9  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  35.71 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0282  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.64 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.52 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3055  hypothetical protein  30.49 
 
 		 94 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0517698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.6 
 
 		 599 aa  42  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  28.16 
 
 		 289 aa  42  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>