16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3055 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3055  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  194  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0517698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  84.72 
 
 		 717 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  80.56 
 
 		 717 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  80.56 
 
 		 717 aa  134  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  81.94 
 
 		 266 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  80.56 
 
 		 266 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  82.61 
 
 		 263 aa  123  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  82.61 
 
 		 263 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.75 
 
 		 217 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.5 
 
 		 599 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  35.38 
 
 		 746 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  32.91 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.86 
 
 		 219 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  41.27 
 
 		 283 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.68 
 
 		 283 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  32.89 
 
 		 289 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>