9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35850 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35850  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109111  normal  0.177404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0282  Bifunctional DNA primase/polymerase  54.31 
 
 		 201 aa  204  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3360  hypothetical protein  33.51 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3600  bifunctional DNA primase/polymerase  32.81 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  25.27 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.32 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  25.57 
 
 		 236 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  24.5 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  25.38 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>