9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0282 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0282  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 
201 aa  394  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35850  hypothetical protein  54.31 
 
 
220 aa  204  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109111  normal  0.177404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3360  hypothetical protein  35.26 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651289  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3600  bifunctional DNA primase/polymerase  33.53 
 
 
226 aa  86.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.53 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.23 
 
 
217 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  27.37 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  26.13 
 
 
220 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.75 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>