30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2304 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  314  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  39.85 
 
 		 667 aa  78.2  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  42.31 
 
 		 746 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  42.31 
 
 		 746 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.25 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.28 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.28 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.15 
 
 		 287 aa  53.9  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.08 
 
 		 283 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  44.3 
 
 		 717 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.45 
 
 		 283 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  33.12 
 
 		 289 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  34 
 
 		 304 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  32.86 
 
 		 749 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  42.68 
 
 		 717 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  31.08 
 
 		 266 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  31.08 
 
 		 266 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  41.77 
 
 		 717 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.13 
 
 		 970 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  31.76 
 
 		 295 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  41.77 
 
 		 263 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  41.77 
 
 		 263 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.29 
 
 		 970 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3090  bifunctional DNA primase/polymerase  29.87 
 
 		 402 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  30.51 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  34.58 
 
 		 290 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  31.78 
 
 		 289 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27533  predicted protein  28.06 
 
 		 423 aa  41.6  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.413255 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.83 
 
 		 305 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  32 
 
 		 746 aa  40.8  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>