35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1983 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  99 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  39.2 
 
 		 955 aa  101  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.62 
 
 		 283 aa  94.4  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  40.37 
 
 		 283 aa  92.8  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.31 
 
 		 970 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.31 
 
 		 970 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  34.18 
 
 		 717 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.95 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  35.96 
 
 		 717 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  37.09 
 
 		 746 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  37.09 
 
 		 746 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  33.16 
 
 		 717 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  37.75 
 
 		 667 aa  73.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  34.57 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  37.08 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  34.57 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  32.7 
 
 		 266 aa  71.2  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  30.07 
 
 		 746 aa  68.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  32.28 
 
 		 266 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  35.26 
 
 		 377 aa  62  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  30.82 
 
 		 749 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.63 
 
 		 304 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.7 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  33.33 
 
 		 391 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  31.14 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  32.28 
 
 		 158 aa  53.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  30 
 
 		 1002 aa  52.8  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.09 
 
 		 1006 aa  51.6  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  36.52 
 
 		 289 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.18 
 
 		 271 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.54 
 
 		 599 aa  48.1  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  31.51 
 
 		 314 aa  46.6  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  25.75 
 
 		 295 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  41.82 
 
 		 183 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>