36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1926 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 377 aa  744    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  57.14 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.33 
 
 		 271 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  34.95 
 
 		 955 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.71 
 
 		 970 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.95 
 
 		 970 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  30.72 
 
 		 749 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.75 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.55 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  34.74 
 
 		 746 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  34.74 
 
 		 746 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  34.45 
 
 		 290 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.7 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.81 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  31.19 
 
 		 717 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  34.91 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  31.19 
 
 		 266 aa  67  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  30.2 
 
 		 717 aa  67  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  35.19 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  30.85 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  29.68 
 
 		 692 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  30.2 
 
 		 717 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.75 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.84 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  30.37 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.26 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  29.07 
 
 		 263 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  25.47 
 
 		 746 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  31.29 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  28.91 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  34.44 
 
 		 719 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.08 
 
 		 599 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  36.36 
 
 		 183 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  30.51 
 
 		 158 aa  42.7  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  25.8 
 
 		 1002 aa  42.7  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  31.43 
 
 		 756 aa  42.7  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>