119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0927 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  100 
 
 
746 aa  1551    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 
746 aa  1551    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  36.43 
 
 
717 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  35.98 
 
 
717 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  35.83 
 
 
717 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  39.55 
 
 
782 aa  325  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  36.99 
 
 
798 aa  287  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  30.54 
 
 
749 aa  278  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  34.68 
 
 
524 aa  277  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  35.51 
 
 
695 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  31.39 
 
 
900 aa  244  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  32.67 
 
 
765 aa  243  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  35.66 
 
 
759 aa  243  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  33.77 
 
 
462 aa  242  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  34.19 
 
 
857 aa  236  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  35.99 
 
 
760 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  32.59 
 
 
755 aa  233  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  32.6 
 
 
482 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  32.12 
 
 
738 aa  211  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  40 
 
 
697 aa  211  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  32.89 
 
 
874 aa  210  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  32.89 
 
 
874 aa  210  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  32.7 
 
 
725 aa  207  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  30.32 
 
 
554 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  32.41 
 
 
882 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  30.3 
 
 
470 aa  198  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  30.91 
 
 
467 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  36.24 
 
 
612 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  24.89 
 
 
723 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  29.45 
 
 
843 aa  177  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  33.53 
 
 
472 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  29.23 
 
 
842 aa  173  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  32.77 
 
 
450 aa  171  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  30.56 
 
 
955 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  32.55 
 
 
485 aa  169  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  36.63 
 
 
613 aa  168  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  29.01 
 
 
774 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  33.23 
 
 
624 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  30.62 
 
 
526 aa  158  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  30.62 
 
 
526 aa  158  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  32.89 
 
 
479 aa  153  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  25.56 
 
 
770 aa  152  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  29.08 
 
 
632 aa  147  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  29.41 
 
 
769 aa  144  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  25.35 
 
 
757 aa  144  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  26.54 
 
 
788 aa  141  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.66 
 
 
283 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.91 
 
 
283 aa  127  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  36.07 
 
 
266 aa  126  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  26.14 
 
 
531 aa  126  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  36.07 
 
 
263 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  34.7 
 
 
263 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  34.26 
 
 
289 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  34.39 
 
 
266 aa  114  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.4 
 
 
287 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  33.8 
 
 
746 aa  103  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  33.2 
 
 
289 aa  103  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  29.75 
 
 
486 aa  101  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  28.76 
 
 
799 aa  101  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  28.85 
 
 
828 aa  98.2  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  29.69 
 
 
486 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  28.01 
 
 
540 aa  93.2  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  34.46 
 
 
183 aa  90.1  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  29.33 
 
 
1061 aa  89  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  38.06 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  32.77 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  24.34 
 
 
1172 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  24.34 
 
 
1172 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.75 
 
 
201 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.09 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  24.52 
 
 
771 aa  77.8  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  23.9 
 
 
978 aa  77.8  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  42.31 
 
 
158 aa  75.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.16 
 
 
599 aa  75.1  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  23.51 
 
 
1145 aa  74.3  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  39.23 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  34.74 
 
 
377 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.7 
 
 
1006 aa  73.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.71 
 
 
970 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  26.87 
 
 
667 aa  71.6  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  26.33 
 
 
606 aa  71.6  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  32.47 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.14 
 
 
970 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  22.96 
 
 
1036 aa  68.2  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  25.17 
 
 
636 aa  67.4  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  23.08 
 
 
507 aa  67.8  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.39 
 
 
304 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  24.69 
 
 
1039 aa  65.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.21 
 
 
305 aa  65.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  19.85 
 
 
624 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  31.84 
 
 
391 aa  65.1  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  24.31 
 
 
501 aa  64.7  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.1 
 
 
1002 aa  64.7  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.57 
 
 
271 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  42.42 
 
 
206 aa  61.6  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  22.95 
 
 
1285 aa  60.1  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  21.84 
 
 
1000 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  23.33 
 
 
775 aa  58.2  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  33.79 
 
 
295 aa  57.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  22.92 
 
 
775 aa  57.4  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>