15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_3090 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_3090  bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 402 aa  802    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.92 
 
 		 599 aa  70.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  40.62 
 
 		 290 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  31.71 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  38.82 
 
 		 295 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.87 
 
 		 287 aa  53.1  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  25.18 
 
 		 255 aa  51.6  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.82 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  32.11 
 
 		 749 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  40.59 
 
 		 206 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  36 
 
 		 283 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.65 
 
 		 283 aa  46.6  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  29.87 
 
 		 158 aa  43.5  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  28.39 
 
 		 746 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  28.39 
 
 		 746 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>