33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1451 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 
255 aa  532  1e-150  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  32.27 
 
 
746 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  31.85 
 
 
717 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  31.76 
 
 
717 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  31.56 
 
 
263 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.74 
 
 
283 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  31.15 
 
 
263 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  30.36 
 
 
717 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.74 
 
 
283 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  31.84 
 
 
266 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  31.02 
 
 
266 aa  96.3  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  28.99 
 
 
289 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.06 
 
 
599 aa  89  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  26.67 
 
 
289 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  33.84 
 
 
749 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  32.77 
 
 
746 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  32.77 
 
 
746 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.51 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  29.61 
 
 
692 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  33.63 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  31.19 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.57 
 
 
206 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  25.31 
 
 
667 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  30.64 
 
 
183 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  24.26 
 
 
236 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  26.52 
 
 
391 aa  59.7  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  28.91 
 
 
377 aa  55.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  31.09 
 
 
955 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  31.85 
 
 
314 aa  53.5  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3090  bifunctional DNA primase/polymerase  25.18 
 
 
402 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  41.3 
 
 
304 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  23.67 
 
 
970 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  23.79 
 
 
970 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>