41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4212 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 304 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  43.69 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  41.22 
 
 		 295 aa  175  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.63 
 
 		 970 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  29.6 
 
 		 749 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  34.27 
 
 		 377 aa  97.1  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.63 
 
 		 970 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.96 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.81 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  33.6 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  40.77 
 
 		 746 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  29.74 
 
 		 955 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  40.77 
 
 		 746 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  28.81 
 
 		 746 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  34.06 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.2 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  34.68 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.9 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  29.53 
 
 		 717 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  27.69 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  29.53 
 
 		 717 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  33.93 
 
 		 717 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  31.61 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  30.57 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.05 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.45 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  41.38 
 
 		 599 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  31.74 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.82 
 
 		 201 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  34 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  33.78 
 
 		 667 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  41.3 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  34.21 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  34.67 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.97 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3090  bifunctional DNA primase/polymerase  40.21 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.84 
 
 		 1002 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  32 
 
 		 756 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.07 
 
 		 1006 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  34.12 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.3 
 
 		 400 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>