41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2772 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  70.39 
 
 		 1006 aa  1281    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 1002 aa  2006    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0501  hypothetical protein  53.28 
 
 		 647 aa  585  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000301954  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  31.55 
 
 		 868 aa  238  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  31.55 
 
 		 868 aa  238  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  31.55 
 
 		 868 aa  238  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  28.5 
 
 		 867 aa  224  6e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1346  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.18 
 
 		 289 aa  159  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111909  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_002936  DET0075  hypothetical protein  33.86 
 
 		 397 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1776 aa  101  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.13 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  31.25 
 
 		 289 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  27.11 
 
 		 746 aa  67  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  27.11 
 
 		 746 aa  67  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.85 
 
 		 970 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  32.41 
 
 		 289 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.33 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.13 
 
 		 970 aa  62  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28900  hypothetical protein  24.69 
 
 		 889 aa  60.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.32 
 
 		 283 aa  60.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  26.71 
 
 		 717 aa  60.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  27.24 
 
 		 955 aa  59.7  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.51 
 
 		 271 aa  59.3  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  26.86 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  24.91 
 
 		 717 aa  58.2  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  26.71 
 
 		 717 aa  57.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4396  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1050 aa  57.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.360797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2708  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1038 aa  55.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00403632  hitchhiker  0.00987423 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  29.41 
 
 		 746 aa  53.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  30 
 
 		 201 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  30 
 
 		 201 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  25.09 
 
 		 263 aa  51.6  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  27.05 
 
 		 749 aa  50.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  25.91 
 
 		 658 aa  50.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.89 
 
 		 400 aa  50.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  33.58 
 
 		 633 aa  49.7  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  26.45 
 
 		 266 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  27.57 
 
 		 263 aa  49.7  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  26.45 
 
 		 266 aa  48.9  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  28.34 
 
 		 841 aa  48.5  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  30.53 
 
 		 391 aa  48.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>