18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2843 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2843  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  208  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00805434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  99.02 
 
 
266 aa  207  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  94.12 
 
 
266 aa  196  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  91.18 
 
 
183 aa  191  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  90.2 
 
 
263 aa  189  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  87.25 
 
 
263 aa  185  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  85.71 
 
 
717 aa  160  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  83.52 
 
 
717 aa  157  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  81.32 
 
 
717 aa  154  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  36.36 
 
 
746 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  39.77 
 
 
667 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  32.97 
 
 
289 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.35 
 
 
283 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  43.14 
 
 
723 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.71 
 
 
283 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.04 
 
 
599 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  33.33 
 
 
289 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  33.33 
 
 
757 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>