50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5640 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5640  virulence-associated E family protein  100 
 
 		 761 aa  1568    Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000885028  normal  1 
 
 
 
NC_010465  YPK_1212  virulence-associated E family protein  32.37 
 
 		 725 aa  224  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2155  virulence-associated E  30.3 
 
 		 695 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  29.68 
 
 		 744 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  28.46 
 
 		 736 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1984  virulence-associated E family protein  29.95 
 
 		 509 aa  157  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  27.43 
 
 		 739 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3095  virulence-associated E family protein  31.63 
 
 		 413 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  30.33 
 
 		 835 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1196  virulence-associated E family protein  33.83 
 
 		 818 aa  138  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0427  virulence-associated protein E  28.06 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  27.19 
 
 		 896 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1053  virulence-associated E family protein  28.08 
 
 		 815 aa  121  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.957725  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1690  virulence-associated E family protein  28.5 
 
 		 489 aa  121  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.879464  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1072  virulence-associated E family protein  28.08 
 
 		 815 aa  121  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3057  virulence-associated E family protein  30.15 
 
 		 789 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1413  virulence-associated E family protein  27.04 
 
 		 806 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1237  virulence-associated E family protein  33.6 
 
 		 781 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000496901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  26.99 
 
 		 736 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  28.7 
 
 		 697 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3094  virulence-associated E  27.91 
 
 		 662 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000820429  normal  0.712426 
 
 
-
 
NC_002936  DET1098  virulence-associated protein E, putative  30.88 
 
 		 789 aa  108  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0384  virulence-associated protein E  26.62 
 
 		 788 aa  106  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2850  virulence-associated E family protein  26.62 
 
 		 788 aa  106  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000089982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  27.21 
 
 		 892 aa  94.7  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  26.79 
 
 		 812 aa  90.9  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  27.91 
 
 		 778 aa  86.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0404  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  26.26 
 
 		 431 aa  76.6  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1431  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like  28.39 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1354  hypothetical protein  29.22 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.721853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  40.57 
 
 		 695 aa  65.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3284  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  29.03 
 
 		 748 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.832553  normal  0.553227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5333  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  26.94 
 
 		 749 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300834 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  30.07 
 
 		 795 aa  58.2  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0544  hypothetical protein  23.84 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000201357  normal  0.0617136 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  28.39 
 
 		 778 aa  57.4  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3564  hypothetical protein  39.02 
 
 		 734 aa  56.6  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  26.8 
 
 		 796 aa  54.7  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  26.83 
 
 		 920 aa  54.3  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  29.01 
 
 		 785 aa  53.5  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  34.95 
 
 		 751 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0934  hypothetical protein  28.41 
 
 		 181 aa  51.6  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  27.04 
 
 		 799 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  25.71 
 
 		 794 aa  48.5  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  25.13 
 
 		 925 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  29.53 
 
 		 815 aa  46.6  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 768 aa  45.8  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  30.33 
 
 		 813 aa  45.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  30.33 
 
 		 813 aa  45.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  25 
 
 		 998 aa  44.7  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>