15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3564 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3564  hypothetical protein  100 
 
 		 734 aa  1530    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  34.23 
 
 		 751 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  33.33 
 
 		 695 aa  66.6  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5640  virulence-associated E family protein  39.02 
 
 		 761 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000885028  normal  1 
 
 
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  40.91 
 
 		 857 aa  54.7  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  41.18 
 
 		 736 aa  52.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  27.03 
 
 		 696 aa  49.3  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  27.16 
 
 		 666 aa  48.1  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0802  DnaB-like helicase-like  25.14 
 
 		 557 aa  47.8  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.507024  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  35.96 
 
 		 741 aa  47.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  43.48 
 
 		 1287 aa  47.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  35.44 
 
 		 953 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0957  DnaB-like helicase-like  21.83 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  23.01 
 
 		 684 aa  45.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2915  hypothetical protein  29.37 
 
 		 765 aa  44.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>