26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0022 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0022  ATPase-like protein  100 
 
 
548 aa  1133    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  28.57 
 
 
828 aa  67  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  25.77 
 
 
463 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  26.37 
 
 
695 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  25.74 
 
 
746 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  25.74 
 
 
746 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  21.46 
 
 
542 aa  55.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  26.04 
 
 
482 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  24.74 
 
 
738 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  25.16 
 
 
1039 aa  50.8  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  24.87 
 
 
632 aa  50.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  25.16 
 
 
1036 aa  50.8  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  24.19 
 
 
624 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  26.04 
 
 
462 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  21.94 
 
 
765 aa  48.9  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  23.08 
 
 
636 aa  48.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  21.94 
 
 
759 aa  47.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  24.24 
 
 
470 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  23.27 
 
 
507 aa  45.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  28.85 
 
 
467 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  21.84 
 
 
723 aa  44.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  25.12 
 
 
486 aa  44.3  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  21.43 
 
 
760 aa  44.3  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  21.88 
 
 
524 aa  43.9  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  27.5 
 
 
1061 aa  43.9  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  20.46 
 
 
798 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>