84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1166 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  961    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  50.69 
 
 
462 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  52.52 
 
 
472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  51.49 
 
 
482 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  52.05 
 
 
485 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  45.63 
 
 
738 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  45.07 
 
 
760 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  45.6 
 
 
759 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  44.49 
 
 
765 aa  359  7e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  41.27 
 
 
470 aa  349  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  43.15 
 
 
450 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  40.14 
 
 
755 aa  332  9e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  50.85 
 
 
479 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  34.78 
 
 
798 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  35.88 
 
 
749 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  38.97 
 
 
524 aa  260  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  33.11 
 
 
874 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  33.11 
 
 
874 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  33.41 
 
 
717 aa  239  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  33.63 
 
 
717 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  33.81 
 
 
782 aa  237  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  33.18 
 
 
717 aa  236  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  33.78 
 
 
526 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  33.78 
 
 
526 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  33.18 
 
 
695 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  35.84 
 
 
725 aa  223  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  33.33 
 
 
843 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  30.71 
 
 
746 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  30.71 
 
 
746 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  32.6 
 
 
842 aa  195  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  31.69 
 
 
882 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  29.6 
 
 
900 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  31.11 
 
 
554 aa  187  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  33.24 
 
 
697 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  28.19 
 
 
770 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  28.63 
 
 
857 aa  173  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  29.79 
 
 
723 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  28.48 
 
 
774 aa  166  8e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  28.98 
 
 
788 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  37.74 
 
 
612 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  29.28 
 
 
757 aa  150  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  32.3 
 
 
955 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  31.67 
 
 
613 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  29.91 
 
 
624 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  31.81 
 
 
799 aa  136  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  26.98 
 
 
632 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  24.69 
 
 
769 aa  97.4  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  25.52 
 
 
486 aa  90.5  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  26.8 
 
 
540 aa  87.4  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  26.74 
 
 
828 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  23.26 
 
 
531 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  27.23 
 
 
477 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  24.92 
 
 
486 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  25 
 
 
605 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  24.64 
 
 
606 aa  75.1  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  27.41 
 
 
777 aa  70.5  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  22.92 
 
 
1145 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  25.91 
 
 
501 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  26.69 
 
 
777 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  22.99 
 
 
1172 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  22.99 
 
 
1172 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  22.57 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  27.19 
 
 
777 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  26.69 
 
 
777 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  27.19 
 
 
777 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  25.89 
 
 
771 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  26.32 
 
 
776 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  24.66 
 
 
777 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0564  ATPase-like  22.22 
 
 
902 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0661178  normal  0.572377 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  27.98 
 
 
1061 aa  60.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  24.15 
 
 
636 aa  59.7  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  23.16 
 
 
775 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  23.89 
 
 
775 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  23.76 
 
 
1039 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  24.08 
 
 
763 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  27.5 
 
 
1036 aa  56.6  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  24.08 
 
 
763 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  24.22 
 
 
978 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0022  ATPase-like protein  23.12 
 
 
548 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  20.98 
 
 
542 aa  50.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  27.22 
 
 
624 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  23.63 
 
 
1285 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2574  hypothetical protein  32.08 
 
 
426 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  19.53 
 
 
1000 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>