66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2199 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 		 554 aa  1129    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  42.72 
 
 		 955 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  33.45 
 
 		 624 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  34.06 
 
 		 612 aa  260  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  32.87 
 
 		 613 aa  255  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  34.71 
 
 		 717 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  33.33 
 
 		 798 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  33.77 
 
 		 717 aa  236  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  33.98 
 
 		 717 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  33.12 
 
 		 695 aa  231  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  33.48 
 
 		 782 aa  231  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  30.22 
 
 		 900 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  32.12 
 
 		 749 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  32.17 
 
 		 524 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  33.18 
 
 		 755 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  33.77 
 
 		 738 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  32.37 
 
 		 843 aa  204  4e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  34.15 
 
 		 462 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  29.68 
 
 		 746 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  29.68 
 
 		 746 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  31.4 
 
 		 842 aa  196  8.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  29.96 
 
 		 882 aa  194  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  28.34 
 
 		 723 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  31.53 
 
 		 760 aa  192  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  32.5 
 
 		 759 aa  186  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  29.1 
 
 		 482 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  31.56 
 
 		 765 aa  183  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  32.68 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  28.7 
 
 		 774 aa  179  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  29.25 
 
 		 770 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  31.11 
 
 		 467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  30.26 
 
 		 472 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  29.25 
 
 		 857 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  29.85 
 
 		 485 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  31.49 
 
 		 697 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  27.23 
 
 		 874 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  27.23 
 
 		 874 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  28.82 
 
 		 725 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  29.64 
 
 		 470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  30.61 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  25.37 
 
 		 757 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  29.02 
 
 		 632 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  29.12 
 
 		 540 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  32.03 
 
 		 526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  32.03 
 
 		 526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  22.98 
 
 		 788 aa  111  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  28.78 
 
 		 799 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  24.32 
 
 		 769 aa  97.1  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  27.27 
 
 		 828 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  21.31 
 
 		 531 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  26.39 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  23.78 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  25.23 
 
 		 771 aa  70.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  20.9 
 
 		 1285 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  29.12 
 
 		 1036 aa  58.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  29.12 
 
 		 1039 aa  57.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  25.33 
 
 		 978 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  20.62 
 
 		 606 aa  54.3  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  24.18 
 
 		 775 aa  50.4  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  22.87 
 
 		 775 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5881  DNA primase catalytic core domain protein  23.85 
 
 		 1117 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211197 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  22.81 
 
 		 624 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  22.5 
 
 		 1061 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  21.46 
 
 		 636 aa  45.4  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  24.68 
 
 		 777 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  24.16 
 
 		 776 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>