63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6606 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  100 
 
 		 624 aa  1290    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  36.33 
 
 		 613 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  34.62 
 
 		 612 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  35.53 
 
 		 955 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  33.45 
 
 		 554 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  33.93 
 
 		 717 aa  209  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  33.42 
 
 		 717 aa  208  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  33.68 
 
 		 717 aa  206  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  27.85 
 
 		 882 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  32.67 
 
 		 798 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  32.26 
 
 		 695 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  31.85 
 
 		 782 aa  194  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  26.7 
 
 		 749 aa  193  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  35.28 
 
 		 524 aa  188  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  29.09 
 
 		 842 aa  178  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  26.32 
 
 		 900 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  28.91 
 
 		 843 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  29.24 
 
 		 765 aa  172  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  30.59 
 
 		 760 aa  171  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  34.16 
 
 		 746 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  34.16 
 
 		 746 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  33.44 
 
 		 759 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  31.82 
 
 		 482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  29.74 
 
 		 755 aa  164  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  31.25 
 
 		 738 aa  151  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  32.13 
 
 		 462 aa  151  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  33.33 
 
 		 857 aa  147  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  30.48 
 
 		 770 aa  144  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  26.14 
 
 		 697 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  25.58 
 
 		 723 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  31.25 
 
 		 470 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  28.32 
 
 		 874 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  28.32 
 
 		 874 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  30.21 
 
 		 467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  27.27 
 
 		 540 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  30.5 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  30.59 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  27.09 
 
 		 774 aa  128  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  34.03 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  26.41 
 
 		 725 aa  124  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  24.47 
 
 		 757 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  27.25 
 
 		 526 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  27.25 
 
 		 526 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  32.77 
 
 		 479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  25.36 
 
 		 788 aa  106  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  26.83 
 
 		 632 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  25 
 
 		 486 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  25.16 
 
 		 769 aa  84  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  27 
 
 		 799 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  27.24 
 
 		 828 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  24.33 
 
 		 486 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  21.43 
 
 		 531 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  23.1 
 
 		 606 aa  63.5  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  28.43 
 
 		 1036 aa  62.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  27.92 
 
 		 1039 aa  61.6  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  20.81 
 
 		 463 aa  53.1  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  24.09 
 
 		 1061 aa  52.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  22.3 
 
 		 978 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  19.08 
 
 		 1285 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  22.8 
 
 		 775 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  22.33 
 
 		 624 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  22.64 
 
 		 775 aa  44.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  18.34 
 
 		 1172 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>