26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2574 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2574  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  876    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2139  ATPase-like protein  35.34 
 
 
642 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.51863 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_220  hypothetical protein  37.68 
 
 
727 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0212  hypothetical protein  36.64 
 
 
731 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0078  hypothetical protein  32.92 
 
 
962 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.253673 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5420  hypothetical protein  34.48 
 
 
1170 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0025  hypothetical protein  34.46 
 
 
1194 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.204228  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5286  hypothetical protein  32.86 
 
 
971 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.55512  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0281  hypothetical protein  30.82 
 
 
1065 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503422  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5473  hypothetical protein  31.54 
 
 
1114 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.467574 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0044  hypothetical protein  34.29 
 
 
967 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  31.07 
 
 
1172 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  31.07 
 
 
1172 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5632  hypothetical protein  28.29 
 
 
1138 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000206849 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0011  hypothetical protein  30.61 
 
 
1227 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  27.89 
 
 
1145 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1066  hypothetical protein  30.41 
 
 
1015 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619549  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2159  hypothetical protein  29.93 
 
 
1009 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135027  normal  0.649366 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2115  hypothetical protein  30.61 
 
 
1009 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2179  hypothetical protein  26.88 
 
 
1010 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  24.08 
 
 
882 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  40.74 
 
 
524 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  24.59 
 
 
749 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  32.97 
 
 
462 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  32.65 
 
 
725 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  30.49 
 
 
769 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>