18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2139 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2139  ATPase-like protein  100 
 
 		 642 aa  1319    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.51863 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2574  hypothetical protein  35.34 
 
 		 426 aa  105  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3156  hypothetical protein  28.05 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0396  hypothetical protein, putative phage gene  25.12 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.468414  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  24.87 
 
 		 679 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  26.95 
 
 		 741 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3653  hypothetical protein  26.09 
 
 		 387 aa  51.6  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0212  hypothetical protein  30.16 
 
 		 731 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0961  hypothetical protein  27.13 
 
 		 375 aa  48.5  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0320178 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5751  putative helicase  28.99 
 
 		 569 aa  48.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4830  hypothetical protein  23.98 
 
 		 407 aa  47.4  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.73367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1171  hypothetical protein  23.88 
 
 		 717 aa  47  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00026816  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_220  hypothetical protein  29.37 
 
 		 727 aa  47  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7593  AAA ATPase  27.68 
 
 		 421 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  26.94 
 
 		 692 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  25.25 
 
 		 590 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1507  hypothetical protein  23.84 
 
 		 370 aa  45.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.805531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2266  hypothetical protein  24.5 
 
 		 464 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>