35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_220 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_220  hypothetical protein  100 
 
 		 727 aa  1496    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0212  hypothetical protein  87.71 
 
 		 731 aa  1320    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0321  hypothetical protein  37.01 
 
 		 444 aa  236  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2843  hypothetical protein  31.9 
 
 		 575 aa  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.6316  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1658  hypothetical protein  31.05 
 
 		 694 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.261922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2574  hypothetical protein  37.68 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  28.14 
 
 		 848 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  28.14 
 
 		 746 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2159  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1009 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135027  normal  0.649366 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5286  hypothetical protein  28.3 
 
 		 971 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.55512  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2115  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1009 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5619  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1003 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1066  hypothetical protein  32 
 
 		 1015 aa  58.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0281  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1065 aa  57.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503422  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  34.25 
 
 		 732 aa  57.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  30.2 
 
 		 701 aa  57.4  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2179  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1010 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019283 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0044  hypothetical protein  27.6 
 
 		 967 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0078  hypothetical protein  28.06 
 
 		 962 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.253673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0358  TOPRIM  27.63 
 
 		 328 aa  52.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000814037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1000  hypothetical protein  27.89 
 
 		 430 aa  52  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0021  hypothetical protein  30.51 
 
 		 234 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0011  hypothetical protein  28 
 
 		 1227 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2260  DNA primase-like protein  25.38 
 
 		 922 aa  50.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5420  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1170 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0362  hypothetical protein  25 
 
 		 518 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.843142  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5473  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1114 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.467574 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0693  zinc finger CHC2-family protein  29.09 
 
 		 407 aa  48.9  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.473403  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12671  phiRv2 prophage protein  31.2 
 
 		 475 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4396  hypothetical protein  25 
 
 		 1050 aa  48.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.360797 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5632  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1138 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000206849 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2139  ATPase-like protein  29.37 
 
 		 642 aa  47  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.51863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16940  hypothetical protein  24.2 
 
 		 571 aa  46.2  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1772  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1039 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28900  hypothetical protein  26.94 
 
 		 889 aa  44.7  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>