18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1000 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1000  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  879    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  43.82 
 
 		 848 aa  352  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0362  hypothetical protein  50 
 
 		 518 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.843142  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  43.73 
 
 		 746 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16940  hypothetical protein  46.93 
 
 		 571 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  39.3 
 
 		 732 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  39.72 
 
 		 701 aa  209  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1212  putative phiRv2 prophage protein  37.15 
 
 		 410 aa  200  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12671  phiRv2 prophage protein  36.11 
 
 		 475 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1450  hypothetical protein  36.34 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0174  hypothetical protein  30.91 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4162  hypothetical protein  30.98 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.363234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2298  hypothetical protein  48.81 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1658  hypothetical protein  25.52 
 
 		 694 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.261922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_220  hypothetical protein  27.89 
 
 		 727 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0212  hypothetical protein  25.88 
 
 		 731 aa  50.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2260  DNA primase-like protein  21.6 
 
 		 922 aa  43.9  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2843  hypothetical protein  29.17 
 
 		 575 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.6316  normal  0.249716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>