19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0362 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0362  hypothetical protein  100 
 
 
518 aa  1054    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.843142  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16940  hypothetical protein  60.51 
 
 
571 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  45.36 
 
 
848 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  45.45 
 
 
746 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1000  hypothetical protein  50 
 
 
430 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  38.31 
 
 
732 aa  219  6e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  39.71 
 
 
701 aa  216  9e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12671  phiRv2 prophage protein  36.83 
 
 
475 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00480822  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1212  putative phiRv2 prophage protein  36.12 
 
 
410 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131322  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1450  hypothetical protein  36.34 
 
 
443 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4162  hypothetical protein  35.76 
 
 
429 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.363234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0174  hypothetical protein  30.05 
 
 
383 aa  151  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2298  hypothetical protein  33.94 
 
 
270 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2260  DNA primase-like protein  24.42 
 
 
922 aa  57.4  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0321  hypothetical protein  22.09 
 
 
444 aa  54.7  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_220  hypothetical protein  25 
 
 
727 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0212  hypothetical protein  23.61 
 
 
731 aa  47.4  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2843  hypothetical protein  25.53 
 
 
575 aa  47.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.6316  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1658  hypothetical protein  24.65 
 
 
694 aa  43.5  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.261922  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>