15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12671 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12671  phiRv2 prophage protein  100 
 
 
475 aa  956    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00480822  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1450  hypothetical protein  63.78 
 
 
443 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0174  hypothetical protein  39.1 
 
 
383 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1212  putative phiRv2 prophage protein  37.85 
 
 
410 aa  217  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131322  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  34.42 
 
 
732 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  39.73 
 
 
848 aa  209  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  35.61 
 
 
701 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4162  hypothetical protein  41.59 
 
 
429 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.363234  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0362  hypothetical protein  36.83 
 
 
518 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.843142  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  38.46 
 
 
746 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1000  hypothetical protein  36.11 
 
 
430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16940  hypothetical protein  35.56 
 
 
571 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2298  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  50.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0212  hypothetical protein  30.4 
 
 
731 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_220  hypothetical protein  31.2 
 
 
727 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>