More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2830 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2830  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  100 
 
 		 412 aa  834    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0110893 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0708  transcription termination factor Rho  53.45 
 
 		 659 aa  339  4e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2040  transcription termination factor Rho  48.14 
 
 		 795 aa  338  9.999999999999999e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  48.3 
 
 		 420 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  47.81 
 
 		 602 aa  335  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  50.73 
 
 		 653 aa  335  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  51.3 
 
 		 429 aa  333  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0471  transcription termination factor Rho  47.55 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1173  transcription termination factor Rho  46.98 
 
 		 432 aa  333  4e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.114801  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1553  transcription termination factor Rho  46.99 
 
 		 447 aa  332  8e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000288549  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  50.14 
 
 		 676 aa  332  8e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1292  transcription termination factor Rho  46.7 
 
 		 432 aa  332  9e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.345721  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0572  transcription termination factor Rho  46.7 
 
 		 432 aa  331  1e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.124184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2301  transcription termination factor Rho  49 
 
 		 691 aa  331  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1295  transcription termination factor Rho  46.34 
 
 		 750 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.623564 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  49.86 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  48.89 
 
 		 573 aa  331  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1005  transcription termination factor Rho  47.65 
 
 		 576 aa  330  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  51.64 
 
 		 415 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0443  transcription termination factor Rho  47.48 
 
 		 447 aa  330  3e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0265285  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  50.58 
 
 		 429 aa  330  4e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  51.64 
 
 		 415 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4345  transcription termination factor Rho  48.55 
 
 		 684 aa  329  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  48.7 
 
 		 679 aa  328  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  51.8 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3070  transcription termination factor Rho  48.36 
 
 		 615 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581675  hitchhiker  0.00476927 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2471  transcription termination factor Rho  50.59 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.94389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2181  transcription termination factor Rho  50.59 
 
 		 486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  50.29 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  50.15 
 
 		 492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  48.99 
 
 		 644 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1137  transcription termination factor Rho  46.6 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11324  transcription termination factor Rho  48.27 
 
 		 602 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329237  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  50.29 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1904  transcription termination factor Rho  49.57 
 
 		 662 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  50.29 
 
 		 415 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1356  transcription termination factor Rho  47.79 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00013646  hitchhiker  0.000000585861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3893  transcription termination factor Rho  48.28 
 
 		 663 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3879  transcription termination factor Rho  48.28 
 
 		 663 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3967  transcription termination factor Rho  48.28 
 
 		 663 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.625424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  48.99 
 
 		 605 aa  326  6e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  48.67 
 
 		 414 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1083  transcription termination factor Rho  49.32 
 
 		 474 aa  324  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000288858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1185  transcription termination factor Rho  48.63 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.704725  normal  0.0982227 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0459  transcription termination factor Rho  48.19 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  50.75 
 
 		 415 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0002  transcription termination factor Rho  48.82 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303251  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  48.67 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2892  transcription termination factor Rho  48.82 
 
 		 422 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1231  transcription termination factor Rho  48.82 
 
 		 422 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287939  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0605  transcription termination factor Rho  46.74 
 
 		 447 aa  323  3e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000783157  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0427  transcription termination factor Rho  48.47 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  50.15 
 
 		 429 aa  323  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  50.44 
 
 		 642 aa  323  5e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09300  transcription termination factor Rho  48.77 
 
 		 638 aa  323  5e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.270012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  48.1 
 
 		 429 aa  322  6e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0056  transcription termination factor Rho  46.79 
 
 		 418 aa  322  7e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.624347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  48.84 
 
 		 422 aa  322  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4662  transcription termination factor Rho  46.85 
 
 		 604 aa  322  7e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18390  transcription termination factor Rho  47.5 
 
 		 721 aa  322  7e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.945824 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1344  transcription termination factor Rho  45.92 
 
 		 431 aa  322  8e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000288127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  51.04 
 
 		 415 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  48.1 
 
 		 421 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2560  transcription termination factor Rho  46.09 
 
 		 406 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.910753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  47.67 
 
 		 421 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3453  transcription termination factor Rho  48.97 
 
 		 423 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0274  transcription termination factor Rho  46.2 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000543073  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01045  transcription termination factor Rho  45.78 
 
 		 579 aa  321  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  49.55 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  47.81 
 
 		 421 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0009  transcription termination factor Rho  48.97 
 
 		 421 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000017892  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0778  transcription termination factor Rho  48.65 
 
 		 419 aa  320  3e-86  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2668  transcription termination factor Rho  48.22 
 
 		 422 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.169241  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0110  transcription termination factor Rho  47.97 
 
 		 656 aa  320  3e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  50.45 
 
 		 415 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  47.81 
 
 		 421 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3722  transcription termination factor Rho  49.71 
 
 		 698 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.672937  normal  0.45086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  47.98 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23670  transcription termination factor Rho  49.05 
 
 		 685 aa  319  5e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0108296  normal  0.784338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1058  transcription termination factor Rho  47.56 
 
 		 658 aa  319  5e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  48.1 
 
 		 421 aa  319  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  50.44 
 
 		 458 aa  319  6e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1008  transcription termination factor Rho  49.71 
 
 		 670 aa  319  7e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.588232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  47.33 
 
 		 418 aa  319  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  47.33 
 
 		 418 aa  319  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1088  transcription termination factor Rho  47.67 
 
 		 546 aa  318  9e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00846053  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1266  transcription termination factor Rho  48.43 
 
 		 393 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2863  transcription termination factor Rho  48.39 
 
 		 423 aa  318  9e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  48.13 
 
 		 425 aa  318  9e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1197  transcription termination factor Rho  48.43 
 
 		 393 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215779  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1200  transcription termination factor Rho  47.38 
 
 		 689 aa  318  1e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29930  transcription termination factor Rho  49.13 
 
 		 613 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.660333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0321  transcription termination factor Rho  48.26 
 
 		 662 aa  318  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  48.55 
 
 		 419 aa  318  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  48.69 
 
 		 418 aa  318  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  47.67 
 
 		 421 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  49.12 
 
 		 445 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4150  transcription termination factor Rho  48.99 
 
 		 747 aa  318  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  45.45 
 
 		 418 aa  317  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  47.59 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>