More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0708 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0708  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 659 aa  1338    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  52.15 
 
 		 642 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2040  transcription termination factor Rho  48.01 
 
 		 795 aa  359  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  52.42 
 
 		 445 aa  352  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  52.56 
 
 		 444 aa  352  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1362  transcription termination factor Rho  51.64 
 
 		 432 aa  350  4e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal  0.514608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  52.29 
 
 		 416 aa  350  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1137  transcription termination factor Rho  49.74 
 
 		 393 aa  350  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1185  transcription termination factor Rho  50.42 
 
 		 364 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.704725  normal  0.0982227 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1553  transcription termination factor Rho  49.86 
 
 		 447 aa  346  8.999999999999999e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000288549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  50 
 
 		 518 aa  346  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1266  transcription termination factor Rho  50.7 
 
 		 393 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1197  transcription termination factor Rho  50.7 
 
 		 393 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  52.46 
 
 		 420 aa  343  8e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_002620  TC0778  transcription termination factor Rho  49.04 
 
 		 419 aa  340  4e-92  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01045  transcription termination factor Rho  40.95 
 
 		 579 aa  340  5.9999999999999996e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1103  transcription termination factor Rho  50.41 
 
 		 425 aa  340  7e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0575951  hitchhiker  0.00481193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2830  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  53.45 
 
 		 412 aa  339  9e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0110893 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  48.35 
 
 		 653 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1083  transcription termination factor Rho  49.86 
 
 		 474 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000288858  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2038  transcription termination factor Rho  51.37 
 
 		 430 aa  338  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0991025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  49.16 
 
 		 429 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  46.88 
 
 		 690 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4906  transcription termination factor Rho  49.86 
 
 		 420 aa  336  7.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.957069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  49.2 
 
 		 644 aa  335  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0978  transcription termination factor Rho  48.48 
 
 		 423 aa  335  2e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000458631  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  48.04 
 
 		 429 aa  334  3e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  49.2 
 
 		 605 aa  334  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  48.04 
 
 		 429 aa  333  5e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  47.98 
 
 		 450 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1173  transcription termination factor Rho  48.06 
 
 		 432 aa  333  5e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.114801  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2638  transcription termination factor Rho  49.57 
 
 		 420 aa  333  5e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105772  hitchhiker  0.00838522 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  47.97 
 
 		 419 aa  333  6e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1292  transcription termination factor Rho  47.78 
 
 		 432 aa  333  9e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.345721  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0572  transcription termination factor Rho  47.78 
 
 		 432 aa  332  9e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.124184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  50.14 
 
 		 437 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1189  transcription termination factor  50.13 
 
 		 424 aa  332  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000172016  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0410  transcription termination factor Rho  47.58 
 
 		 650 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000426411  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  49.42 
 
 		 429 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0471  transcription termination factor Rho  48.06 
 
 		 434 aa  332  2e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  48.14 
 
 		 679 aa  332  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  47.92 
 
 		 415 aa  331  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3081  transcription termination factor Rho  47.43 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2358  transcription termination factor Rho  47.8 
 
 		 420 aa  331  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.139464  normal  0.694538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1500  transcription termination factor Rho  47.8 
 
 		 420 aa  331  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  50.14 
 
 		 434 aa  331  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2604  transcription termination factor Rho  49.29 
 
 		 420 aa  331  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4345  transcription termination factor Rho  47.73 
 
 		 684 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1904  transcription termination factor Rho  47.57 
 
 		 662 aa  330  4e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  48.31 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  47.12 
 
 		 422 aa  330  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0459  transcription termination factor Rho  49.42 
 
 		 429 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1215  transcription termination factor Rho  49.87 
 
 		 424 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000539864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  51.78 
 
 		 418 aa  330  6e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  51.78 
 
 		 418 aa  330  6e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1295  transcription termination factor Rho  44.81 
 
 		 750 aa  330  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.623564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4150  transcription termination factor Rho  48.14 
 
 		 747 aa  330  7e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1308  transcription termination factor Rho  48.53 
 
 		 420 aa  330  7e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  49.86 
 
 		 437 aa  330  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  47.21 
 
 		 429 aa  329  9e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0605  transcription termination factor Rho  49.14 
 
 		 447 aa  329  9e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000783157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  47.54 
 
 		 415 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  49.32 
 
 		 436 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  48.65 
 
 		 419 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0638  transcription termination factor Rho  48.26 
 
 		 420 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  48.65 
 
 		 419 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0499  transcription termination factor Rho  48.4 
 
 		 497 aa  328  2.0000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000619502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  48.65 
 
 		 419 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  48.65 
 
 		 419 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1058  transcription termination factor Rho  46.95 
 
 		 658 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0427  transcription termination factor Rho  48.26 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1778  transcription termination factor Rho  46.53 
 
 		 549 aa  327  3e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  44.63 
 
 		 573 aa  328  3e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1853  transcription termination factor Rho  47.17 
 
 		 420 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.110087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  48.79 
 
 		 704 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5130  transcription termination factor Rho  47.17 
 
 		 420 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923516  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0274  transcription termination factor Rho  49.14 
 
 		 446 aa  327  4.0000000000000003e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000543073  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2899  transcription termination factor Rho  48.15 
 
 		 420 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321036  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  50 
 
 		 419 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1444  transcription termination factor Rho  47.17 
 
 		 420 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440911  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6250  transcription termination factor Rho  47.17 
 
 		 420 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  44.93 
 
 		 602 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1829  transcription termination factor Rho  47.17 
 
 		 420 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156095  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1864  transcription termination factor Rho  47.77 
 
 		 496 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.462467  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  50.13 
 
 		 457 aa  327  5e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  47.09 
 
 		 415 aa  327  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  49.59 
 
 		 424 aa  327  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  46.03 
 
 		 422 aa  327  5e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2532  transcription termination factor Rho  45.63 
 
 		 422 aa  327  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  49.04 
 
 		 418 aa  327  5e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  49.72 
 
 		 419 aa  327  6e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  49.72 
 
 		 419 aa  327  6e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  49.72 
 
 		 419 aa  326  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  49.72 
 
 		 419 aa  326  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  49.72 
 
 		 419 aa  326  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  49.72 
 
 		 419 aa  326  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  49.72 
 
 		 419 aa  326  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4034  transcription termination factor Rho  49.73 
 
 		 419 aa  326  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462931  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0180  transcription termination factor Rho  49.73 
 
 		 419 aa  326  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0511  transcription termination factor Rho  49.73 
 
 		 419 aa  326  8.000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0322242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>