More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0978 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0978  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 423 aa  840    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000458631  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0679  transcription termination factor Rho  72.81 
 
 		 439 aa  636    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000809271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  61.07 
 
 		 415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  60.29 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  60.43 
 
 		 415 aa  512  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  60.53 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  60.53 
 
 		 415 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  60.44 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  61.24 
 
 		 429 aa  508  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  59.12 
 
 		 416 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  59.12 
 
 		 503 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  59.81 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  64.36 
 
 		 518 aa  502  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  60.77 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  60.67 
 
 		 429 aa  502  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  61.48 
 
 		 429 aa  502  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  59.81 
 
 		 419 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  57.55 
 
 		 431 aa  498  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  59.81 
 
 		 419 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  59.81 
 
 		 419 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  59.81 
 
 		 419 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0459  transcription termination factor Rho  59.33 
 
 		 429 aa  498  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  57.89 
 
 		 449 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  59.81 
 
 		 429 aa  498  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  58.6 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  59.81 
 
 		 419 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0499  transcription termination factor Rho  58.37 
 
 		 497 aa  501  1e-140  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000619502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  59.81 
 
 		 419 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  59.81 
 
 		 419 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  60.77 
 
 		 429 aa  501  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  59.81 
 
 		 419 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  59.09 
 
 		 437 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0427  transcription termination factor Rho  59.57 
 
 		 429 aa  495  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  59.29 
 
 		 437 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  58.6 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  56.9 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  56.72 
 
 		 548 aa  492  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  59.18 
 
 		 418 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  59.47 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  58.84 
 
 		 418 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  57.31 
 
 		 418 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  59.47 
 
 		 421 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 421 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  59.71 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  59.71 
 
 		 421 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  59.18 
 
 		 418 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  59.09 
 
 		 422 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0726  transcription termination factor Rho  59.32 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  58.64 
 
 		 437 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0725  transcription termination factor Rho  59.32 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1187  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 420 aa  488  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.481707 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  58.01 
 
 		 415 aa  491  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0309  transcription termination factor Rho  59.81 
 
 		 419 aa  488  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  59.23 
 
 		 421 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  59.23 
 
 		 421 aa  491  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  57.38 
 
 		 424 aa  491  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  56.5 
 
 		 436 aa  488  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  58.17 
 
 		 421 aa  488  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2835  transcription termination factor Rho  56.73 
 
 		 418 aa  484  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1444  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 420 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440911  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3081  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 484 aa  486  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1123  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 420 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117933  normal  0.145069 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3002  transcription termination factor Rho  57.38 
 
 		 420 aa  484  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2863  transcription termination factor Rho  57.38 
 
 		 420 aa  484  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2998  transcription termination factor Rho  56.9 
 
 		 419 aa  484  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0194587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47410  transcription termination factor Rho  59.56 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5130  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 420 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923516  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1853  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 420 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.110087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  57.55 
 
 		 421 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1031  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 420 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0464905  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  57.83 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2363  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016195  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  57.21 
 
 		 421 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6250  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 420 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156064  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  61.6 
 
 		 573 aa  486  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  57.49 
 
 		 420 aa  485  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  57.07 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1829  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 420 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156095  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1824  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025276  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1855  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0042  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133554  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1292  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.345721  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  57.21 
 
 		 421 aa  484  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1842  transcription termination factor Rho  56.59 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.660399 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1365  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0123945  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1740  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 420 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318458  normal  0.139414 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2217  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 420 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0809447  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  57.55 
 
 		 418 aa  482  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2248  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 420 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.336797  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1126  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722702  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1308  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  57.21 
 
 		 418 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2210  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 420 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1563  transcription termination factor Rho  56.73 
 
 		 506 aa  482  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657404 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1767  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 420 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548344  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0471  transcription termination factor Rho  57.38 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>