More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0679 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0679  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 439 aa  890    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000809271  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0978  transcription termination factor Rho  72.81 
 
 		 423 aa  625  1e-178  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000458631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  59.86 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  60.56 
 
 		 415 aa  521  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  59.06 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  58.74 
 
 		 418 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  58.74 
 
 		 418 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  58.82 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  59.06 
 
 		 415 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  57.38 
 
 		 419 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  56.38 
 
 		 437 aa  509  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  58.92 
 
 		 415 aa  511  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  57.75 
 
 		 415 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  57.28 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  57.85 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  57.75 
 
 		 415 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  63.21 
 
 		 518 aa  502  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  56.94 
 
 		 416 aa  502  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00570  transcription termination factor Rho  58.18 
 
 		 421 aa  500  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.576624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  57.98 
 
 		 415 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 		 419 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  56.78 
 
 		 503 aa  498  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  57.94 
 
 		 419 aa  501  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  57.71 
 
 		 419 aa  500  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3217  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 		 420 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  58.18 
 
 		 419 aa  500  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  56.91 
 
 		 548 aa  495  1e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  56.11 
 
 		 429 aa  494  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  56.78 
 
 		 419 aa  494  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  57.71 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  57.71 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2998  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0194587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1824  transcription termination factor Rho  58.31 
 
 		 422 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025276  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1853  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.110087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5130  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923516  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0397  transcription termination factor Rho  58.18 
 
 		 421 aa  495  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  56.47 
 
 		 449 aa  497  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  56.51 
 
 		 418 aa  498  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  57.44 
 
 		 419 aa  498  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  56.31 
 
 		 431 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2363  transcription termination factor Rho  58.31 
 
 		 422 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016195  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  56.51 
 
 		 418 aa  498  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6250  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156064  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2055  transcription termination factor Rho  56.91 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.224008  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0949  transcription termination factor Rho  58.31 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.545356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0409  transcription termination factor Rho  58.18 
 
 		 421 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3616  transcription termination factor Rho  58.18 
 
 		 421 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  57.71 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1444  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 420 aa  494  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440911  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1829  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156095  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  55.63 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0408  transcription termination factor Rho  58.18 
 
 		 421 aa  494  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.011685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  57.71 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  57.34 
 
 		 420 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  57.24 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  57.24 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  57.48 
 
 		 419 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4111  transcription termination factor Rho  57.71 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0405  transcription termination factor Rho  58.18 
 
 		 421 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0042  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133554  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3930  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 		 421 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2210  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1365  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0123945  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  56.33 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  57.24 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1308  transcription termination factor Rho  56.67 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1740  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318458  normal  0.139414 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2375  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0148  transcription termination factor Rho  57.94 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00136527  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0337  transcription termination factor Rho  57.71 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1855  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2217  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 420 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0809447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2248  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.336797  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1126  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722702  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3953  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 		 421 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0512  transcription termination factor Rho  57.94 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.855654  hitchhiker  0.00605573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0447  transcription termination factor Rho  58.18 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  56.84 
 
 		 437 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  56.33 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3434  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 		 421 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4223  transcription termination factor Rho  58.18 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0343455  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4071  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 		 421 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.339421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0459  transcription termination factor Rho  58.18 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  57.24 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1767  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  56.78 
 
 		 429 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3878  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 		 421 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>