More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1185 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1266  transcription termination factor Rho  93.3 
 
 
393 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1197  transcription termination factor Rho  93.3 
 
 
393 aa  677    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1185  transcription termination factor Rho  100 
 
 
364 aa  729    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.704725  normal  0.0982227 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1137  transcription termination factor Rho  93.94 
 
 
393 aa  688    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0778  transcription termination factor Rho  56.35 
 
 
419 aa  390  1e-107  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2358  transcription termination factor Rho  54.79 
 
 
420 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.139464  normal  0.694538 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  55.4 
 
 
415 aa  388  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1500  transcription termination factor Rho  54.52 
 
 
420 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  55.15 
 
 
429 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  55.43 
 
 
429 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  54.87 
 
 
429 aa  384  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2638  transcription termination factor Rho  54.14 
 
 
420 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105772  hitchhiker  0.00838522 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  57.1 
 
 
415 aa  383  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2604  transcription termination factor Rho  53.59 
 
 
420 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3002  transcription termination factor Rho  54.25 
 
 
420 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2863  transcription termination factor Rho  54.25 
 
 
420 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  56.08 
 
 
415 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  53.76 
 
 
429 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4906  transcription termination factor Rho  53.87 
 
 
420 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.957069 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0459  transcription termination factor Rho  54.32 
 
 
429 aa  381  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  55.34 
 
 
418 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  54.02 
 
 
450 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  53.59 
 
 
415 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  55.49 
 
 
436 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  53.85 
 
 
421 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  54.7 
 
 
437 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  53.48 
 
 
429 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  54.12 
 
 
421 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  54.97 
 
 
415 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  53.85 
 
 
421 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  54.77 
 
 
422 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0427  transcription termination factor Rho  53.48 
 
 
429 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  55.25 
 
 
415 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  53.85 
 
 
418 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  53.57 
 
 
421 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  53.57 
 
 
421 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  55.37 
 
 
437 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  54.79 
 
 
419 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0725  transcription termination factor Rho  55.37 
 
 
417 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  55.37 
 
 
437 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  54.1 
 
 
422 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0726  transcription termination factor Rho  55.37 
 
 
417 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  55.89 
 
 
421 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1968  transcription termination factor Rho  54.07 
 
 
435 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  53.85 
 
 
421 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  57.02 
 
 
679 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  56.79 
 
 
458 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0638  transcription termination factor Rho  52.76 
 
 
420 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  54.85 
 
 
436 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  53.97 
 
 
421 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  53.7 
 
 
419 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1231  transcription termination factor Rho  53.85 
 
 
422 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287939  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  53.89 
 
 
503 aa  371  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  53.97 
 
 
421 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2085  transcription termination factor Rho  53.85 
 
 
419 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2892  transcription termination factor Rho  53.85 
 
 
422 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  53.7 
 
 
421 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2899  transcription termination factor Rho  52.76 
 
 
420 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  53.7 
 
 
421 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  55.22 
 
 
418 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  55.22 
 
 
418 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  53.57 
 
 
429 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1308  transcription termination factor Rho  53.04 
 
 
420 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  57.89 
 
 
605 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  53.44 
 
 
425 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  53.7 
 
 
419 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  53.97 
 
 
421 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  57.02 
 
 
676 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  54.29 
 
 
415 aa  371  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1088  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 
546 aa  373  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00846053  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2532  transcription termination factor Rho  54.37 
 
 
422 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0056  transcription termination factor Rho  54.7 
 
 
418 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.624347  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  53.72 
 
 
653 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  53.59 
 
 
415 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0009  transcription termination factor Rho  53.01 
 
 
421 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000017892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  54.25 
 
 
419 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  54.25 
 
 
419 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2322  transcription termination factor Rho  52.34 
 
 
421 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  54.05 
 
 
424 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2668  transcription termination factor Rho  53.85 
 
 
422 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.169241  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  54.4 
 
 
418 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  54.12 
 
 
418 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2835  transcription termination factor Rho  53.7 
 
 
418 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  53.15 
 
 
421 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  53.7 
 
 
419 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2262  transcription termination factor Rho  52.49 
 
 
420 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.883026  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  53.57 
 
 
436 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  54.75 
 
 
518 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  53.42 
 
 
421 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  54.02 
 
 
414 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  54.02 
 
 
416 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  53.59 
 
 
415 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4223  transcription termination factor Rho  53.42 
 
 
433 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0343455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2040  transcription termination factor Rho  50.14 
 
 
795 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  52.88 
 
 
418 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  53.85 
 
 
436 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  53.02 
 
 
492 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  53.85 
 
 
421 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  53.28 
 
 
420 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0447  transcription termination factor Rho  54.27 
 
 
421 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>