More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1266 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1137  transcription termination factor Rho  98.47 
 
 		 393 aa  778    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1197  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 393 aa  787    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1185  transcription termination factor Rho  93.39 
 
 		 364 aa  687    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.704725  normal  0.0982227 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1266  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 393 aa  787    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  54.57 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  53.17 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  55.4 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0778  transcription termination factor Rho  54.95 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  54.64 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  54.64 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0459  transcription termination factor Rho  54.57 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  54.1 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  54.37 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  53.33 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  53.28 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1500  transcription termination factor Rho  52.8 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2358  transcription termination factor Rho  52.8 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.139464  normal  0.694538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  53.55 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0427  transcription termination factor Rho  54.02 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  53.68 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  53.46 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  54.12 
 
 		 415 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  51.32 
 
 		 429 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  53.08 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  58.19 
 
 		 605 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  57.02 
 
 		 679 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2638  transcription termination factor Rho  52.42 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105772  hitchhiker  0.00838522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4906  transcription termination factor Rho  51.34 
 
 		 420 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.957069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  51.54 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0009  transcription termination factor Rho  52.73 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000017892  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  56.73 
 
 		 676 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  53.07 
 
 		 415 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  55.92 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  52.12 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  52.25 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3002  transcription termination factor Rho  52.6 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2863  transcription termination factor Rho  52.6 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  52.25 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1231  transcription termination factor Rho  52 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  53.85 
 
 		 415 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  53.7 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  52.08 
 
 		 450 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2892  transcription termination factor Rho  52 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  52.86 
 
 		 419 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  50.26 
 
 		 492 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  53.15 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0725  transcription termination factor Rho  53.72 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0726  transcription termination factor Rho  53.72 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  53.97 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  53.3 
 
 		 415 aa  364  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2668  transcription termination factor Rho  52.27 
 
 		 422 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.169241  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3567  transcription termination factor Rho  54.9 
 
 		 422 aa  365  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235782  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  52.23 
 
 		 437 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  52.85 
 
 		 422 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  53.44 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  51.46 
 
 		 419 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  54.57 
 
 		 415 aa  364  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  51.46 
 
 		 419 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  52.86 
 
 		 421 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  52.38 
 
 		 418 aa  363  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  52.25 
 
 		 419 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2604  transcription termination factor Rho  51.61 
 
 		 420 aa  364  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 		 518 aa  363  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  53.44 
 
 		 414 aa  364  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3676  transcription termination factor Rho  53.97 
 
 		 583 aa  363  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.939305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  51.72 
 
 		 419 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  51.72 
 
 		 419 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  51.72 
 
 		 419 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  51.72 
 
 		 419 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  53.3 
 
 		 415 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  52 
 
 		 653 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  53.01 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  51.33 
 
 		 419 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  53.3 
 
 		 415 aa  363  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  53.28 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  51.75 
 
 		 425 aa  363  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  52.75 
 
 		 415 aa  363  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  53.01 
 
 		 418 aa  362  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  53.01 
 
 		 418 aa  362  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  51.71 
 
 		 690 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  51.6 
 
 		 428 aa  362  6e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  54.1 
 
 		 421 aa  362  7.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  51.06 
 
 		 419 aa  362  7.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  52.59 
 
 		 421 aa  362  8e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  53.61 
 
 		 503 aa  362  8e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  52.09 
 
 		 424 aa  362  8e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  51.33 
 
 		 420 aa  362  8e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  52.86 
 
 		 421 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2532  transcription termination factor Rho  54.34 
 
 		 422 aa  362  9e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  52.32 
 
 		 421 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  51.87 
 
 		 450 aa  360  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1308  transcription termination factor Rho  51.08 
 
 		 420 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2899  transcription termination factor Rho  51.34 
 
 		 420 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  52.41 
 
 		 419 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3453  transcription termination factor Rho  52.05 
 
 		 423 aa  360  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  51.73 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  52.32 
 
 		 421 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  51.73 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  51.73 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  51.73 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>