More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2638 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1853  transcription termination factor Rho  75.24 
 
 
420 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.110087 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1187  transcription termination factor Rho  76.43 
 
 
420 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.481707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1282  transcription termination factor Rho  81.9 
 
 
430 aa  727    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0183251  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1031  transcription termination factor Rho  76.19 
 
 
420 aa  681    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0464905  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1740  transcription termination factor Rho  75.24 
 
 
420 aa  679    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318458  normal  0.139414 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0042  transcription termination factor Rho  75 
 
 
420 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2210  transcription termination factor Rho  75.24 
 
 
420 aa  679    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2322  transcription termination factor Rho  92.87 
 
 
421 aa  803    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1365  transcription termination factor Rho  75 
 
 
420 aa  677    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0123945  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3081  transcription termination factor Rho  72.32 
 
 
484 aa  652    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2998  transcription termination factor Rho  71.84 
 
 
419 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0194587  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1855  transcription termination factor Rho  75 
 
 
420 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2118  transcription termination factor Rho  76.19 
 
 
420 aa  678    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299268  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0638  transcription termination factor Rho  74.05 
 
 
420 aa  655    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0037  transcription termination factor Rho  70.88 
 
 
419 aa  635    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.245355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0949  transcription termination factor Rho  75.95 
 
 
420 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.545356 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2375  transcription termination factor Rho  75.24 
 
 
420 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5130  transcription termination factor Rho  75.24 
 
 
420 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923516  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4906  transcription termination factor Rho  94.29 
 
 
420 aa  813    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.957069 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1123  transcription termination factor Rho  76.19 
 
 
420 aa  681    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117933  normal  0.145069 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2085  transcription termination factor Rho  72.01 
 
 
419 aa  649    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1308  transcription termination factor Rho  74.52 
 
 
420 aa  659    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2217  transcription termination factor Rho  75.24 
 
 
420 aa  678    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0809447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1444  transcription termination factor Rho  75 
 
 
420 aa  677    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440911  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2899  transcription termination factor Rho  90.71 
 
 
420 aa  791    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321036  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  72.32 
 
 
419 aa  653    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2262  transcription termination factor Rho  87.62 
 
 
420 aa  765    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.883026  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2363  transcription termination factor Rho  75.95 
 
 
422 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016195  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1824  transcription termination factor Rho  75.95 
 
 
422 aa  682    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025276  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1500  transcription termination factor Rho  95.24 
 
 
420 aa  820    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2135  transcription termination factor Rho  75.95 
 
 
420 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173843  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2638  transcription termination factor Rho  100 
 
 
420 aa  855    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105772  hitchhiker  0.00838522 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6250  transcription termination factor Rho  75.24 
 
 
420 aa  679    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156064  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2806  transcription termination factor Rho  80 
 
 
420 aa  708    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2248  transcription termination factor Rho  75.24 
 
 
420 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.336797  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1767  transcription termination factor Rho  75.24 
 
 
420 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548344  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2196  transcription termination factor Rho  86.67 
 
 
420 aa  761    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.430526  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1829  transcription termination factor Rho  75.24 
 
 
420 aa  679    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2604  transcription termination factor Rho  96.43 
 
 
420 aa  830    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1126  transcription termination factor Rho  75 
 
 
420 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722702  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2358  transcription termination factor Rho  95.48 
 
 
420 aa  822    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.139464  normal  0.694538 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  67.22 
 
 
418 aa  600  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03719  transcription termination factor Rho  69.06 
 
 
629 aa  597  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  67.06 
 
 
419 aa  595  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  66.67 
 
 
418 aa  592  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  66.67 
 
 
418 aa  592  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3676  transcription termination factor Rho  69.06 
 
 
583 aa  594  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.939305 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2158  transcription termination factor Rho  68.11 
 
 
564 aa  594  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.156319  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  67.94 
 
 
419 aa  588  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0056  transcription termination factor Rho  65.79 
 
 
418 aa  589  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.624347  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  67.94 
 
 
419 aa  589  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  65.55 
 
 
419 aa  588  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4003  transcription termination factor Rho  67.46 
 
 
419 aa  589  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499603  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  66.99 
 
 
419 aa  588  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  66.11 
 
 
419 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  66.75 
 
 
419 aa  586  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2055  transcription termination factor Rho  65.87 
 
 
419 aa  585  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.224008  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  66.75 
 
 
419 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  66.99 
 
 
450 aa  586  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  66.51 
 
 
419 aa  585  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  66.75 
 
 
419 aa  586  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  66.75 
 
 
419 aa  586  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  67.46 
 
 
419 aa  586  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  66.75 
 
 
419 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4203  transcription termination factor Rho  66.99 
 
 
450 aa  586  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  66.51 
 
 
419 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  66.75 
 
 
419 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  66.75 
 
 
419 aa  586  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  66.75 
 
 
419 aa  586  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  66.75 
 
 
419 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00570  transcription termination factor Rho  66.03 
 
 
421 aa  585  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.576624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  66.51 
 
 
419 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  66.75 
 
 
419 aa  584  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  66.75 
 
 
419 aa  586  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  66.75 
 
 
419 aa  586  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  66.75 
 
 
419 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  66.51 
 
 
419 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  66.51 
 
 
419 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  66.51 
 
 
419 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  66.75 
 
 
419 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  66.51 
 
 
419 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0148  transcription termination factor Rho  66.99 
 
 
419 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00136527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  66.51 
 
 
419 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0459  transcription termination factor Rho  66.59 
 
 
420 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4111  transcription termination factor Rho  66.35 
 
 
421 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313563 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  66.51 
 
 
419 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0397  transcription termination factor Rho  65.87 
 
 
421 aa  578  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0405  transcription termination factor Rho  66.35 
 
 
421 aa  580  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3002  transcription termination factor Rho  65.07 
 
 
420 aa  580  1e-164  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2863  transcription termination factor Rho  65.07 
 
 
420 aa  580  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  66.51 
 
 
419 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4034  transcription termination factor Rho  66.27 
 
 
419 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462931  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2310  transcription termination factor Rho  66.03 
 
 
432 aa  578  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  normal  0.229849 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0447  transcription termination factor Rho  66.35 
 
 
421 aa  580  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0511  transcription termination factor Rho  66.27 
 
 
419 aa  580  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0322242 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0409  transcription termination factor Rho  66.11 
 
 
421 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3616  transcription termination factor Rho  66.11 
 
 
421 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0337  transcription termination factor Rho  66.11 
 
 
421 aa  578  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0408  transcription termination factor Rho  66.11 
 
 
421 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.011685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3217  transcription termination factor Rho  66.11 
 
 
420 aa  578  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>