More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1362 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1362  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 432 aa  865    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal  0.514608 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1103  transcription termination factor Rho  74.4 
 
 		 425 aa  641    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0575951  hitchhiker  0.00481193 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2038  transcription termination factor Rho  87.47 
 
 		 430 aa  723    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0991025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  55.69 
 
 		 642 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  55.83 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  57.38 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  58.11 
 
 		 424 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  55.74 
 
 		 457 aa  455  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  55.58 
 
 		 450 aa  454  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 423 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 423 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  55.26 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0978  transcription termination factor Rho  55.88 
 
 		 423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000458631  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  55.26 
 
 		 444 aa  451  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  55.31 
 
 		 418 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  57.38 
 
 		 423 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  60.66 
 
 		 653 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 423 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  53.81 
 
 		 503 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  54.22 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  54.17 
 
 		 416 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  53.4 
 
 		 414 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  53.3 
 
 		 425 aa  438  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  54.99 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  53.46 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  59.44 
 
 		 690 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  53.01 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1728  transcription termination factor Rho  53.03 
 
 		 438 aa  435  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00025665  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2195  transcription termination factor Rho  53.03 
 
 		 438 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00569958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  58.4 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  53.28 
 
 		 415 aa  434  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  52.42 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2157  transcription termination factor Rho  53.03 
 
 		 438 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.894966  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1189  transcription termination factor  56.31 
 
 		 424 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000172016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  52.42 
 
 		 415 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3599  transcription termination factor Rho  54.74 
 
 		 470 aa  430  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  52.29 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  52.53 
 
 		 415 aa  428  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1083  transcription termination factor Rho  50.43 
 
 		 474 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000288858  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1215  transcription termination factor Rho  56.31 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000539864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  52.42 
 
 		 415 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0281  transcription termination factor Rho  52.07 
 
 		 422 aa  426  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.697975  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1393  transcription termination factor Rho  51.45 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.107129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  51.65 
 
 		 414 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  52.25 
 
 		 415 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  52.13 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0679  transcription termination factor Rho  51.76 
 
 		 439 aa  427  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000809271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  54.65 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  51.9 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  51.45 
 
 		 415 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  52.37 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  52.26 
 
 		 429 aa  423  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  52.17 
 
 		 415 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1553  transcription termination factor Rho  50.93 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000288549  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1356  transcription termination factor Rho  57.58 
 
 		 417 aa  423  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00013646  hitchhiker  0.000000585861 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  52.84 
 
 		 429 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1292  transcription termination factor Rho  51.44 
 
 		 432 aa  418  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.345721  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  57.72 
 
 		 518 aa  419  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1421  transcription termination factor Rho  52.43 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0605  transcription termination factor Rho  49.66 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000783157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  51.21 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  51.67 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  50.84 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0572  transcription termination factor Rho  51.2 
 
 		 432 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.124184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  51.67 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  51.9 
 
 		 419 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  51.9 
 
 		 419 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  51.67 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  51.67 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  52.38 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1344  transcription termination factor Rho  51.36 
 
 		 431 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000288127  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0459  transcription termination factor Rho  51.08 
 
 		 429 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  51.21 
 
 		 415 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1173  transcription termination factor Rho  51.2 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.114801  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0427  transcription termination factor Rho  50.95 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23670  transcription termination factor Rho  53.17 
 
 		 685 aa  415  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0108296  normal  0.784338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  51.43 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0410  transcription termination factor Rho  49.44 
 
 		 650 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000426411  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  50.84 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  51.09 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  51.56 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0274  transcription termination factor Rho  50.85 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000543073  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  51.56 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  57.46 
 
 		 492 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  51.43 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  50.82 
 
 		 421 aa  415  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  49.64 
 
 		 548 aa  412  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0443  transcription termination factor Rho  49.88 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0265285  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0471  transcription termination factor Rho  51.61 
 
 		 434 aa  413  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2402  transcription termination factor Rho  53.79 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  54.67 
 
 		 498 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  51.2 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>