More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1103 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1103  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 425 aa  852    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0575951  hitchhiker  0.00481193 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1362  transcription termination factor Rho  74.4 
 
 		 432 aa  641    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal  0.514608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2038  transcription termination factor Rho  75.41 
 
 		 430 aa  625  1e-178  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0991025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  58.98 
 
 		 444 aa  475  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  58.98 
 
 		 445 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  58.02 
 
 		 642 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  56.83 
 
 		 436 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  57.04 
 
 		 437 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 416 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  55.9 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  56.22 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  55.37 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  57.42 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  55.1 
 
 		 415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  57.8 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  57.35 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  55.85 
 
 		 450 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  55.58 
 
 		 457 aa  448  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  53.61 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  57.11 
 
 		 508 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1393  transcription termination factor Rho  52.45 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.107129  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  55.29 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  54.77 
 
 		 503 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  56.17 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  59.12 
 
 		 653 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  55.93 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  56.17 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  56.17 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  56.17 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0978  transcription termination factor Rho  56.42 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000458631  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  53.12 
 
 		 415 aa  442  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  54.09 
 
 		 414 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  55.93 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  54.2 
 
 		 415 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  54.2 
 
 		 415 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  56.66 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  54.68 
 
 		 415 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  56.17 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  55.69 
 
 		 423 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1728  transcription termination factor Rho  53.19 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00025665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  55.83 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1553  transcription termination factor Rho  54.96 
 
 		 447 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000288549  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  53.4 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2157  transcription termination factor Rho  53.86 
 
 		 438 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.894966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2195  transcription termination factor Rho  53.86 
 
 		 438 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00569958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  54.2 
 
 		 415 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  55.69 
 
 		 423 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  54.03 
 
 		 425 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  51.98 
 
 		 449 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  53.48 
 
 		 415 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  53 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  52.39 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  53.32 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  52.15 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4906  transcription termination factor Rho  55.28 
 
 		 420 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.957069 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0605  transcription termination factor Rho  52.97 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000783157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  54 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  52.22 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  53.73 
 
 		 415 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  51.44 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  51.67 
 
 		 421 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  51.91 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  52.88 
 
 		 415 aa  433  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  52.76 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  52.37 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  51.67 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  53.69 
 
 		 421 aa  434  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1421  transcription termination factor Rho  54.74 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  52.61 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1500  transcription termination factor Rho  54.52 
 
 		 420 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0274  transcription termination factor Rho  52.26 
 
 		 446 aa  428  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000543073  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1173  transcription termination factor Rho  53.64 
 
 		 432 aa  428  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.114801  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1292  transcription termination factor Rho  53.88 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.345721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  58.29 
 
 		 690 aa  430  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1344  transcription termination factor Rho  54.7 
 
 		 431 aa  428  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000288127  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0471  transcription termination factor Rho  55.06 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0459  transcription termination factor Rho  52.22 
 
 		 429 aa  430  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2358  transcription termination factor Rho  54.27 
 
 		 420 aa  431  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.139464  normal  0.694538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2899  transcription termination factor Rho  52.14 
 
 		 420 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321036  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  51.31 
 
 		 422 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  51.67 
 
 		 421 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2135  transcription termination factor Rho  51.92 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173843  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0427  transcription termination factor Rho  52.37 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1356  transcription termination factor Rho  59.23 
 
 		 417 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00013646  hitchhiker  0.000000585861 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  59.07 
 
 		 492 aa  429  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0572  transcription termination factor Rho  53.64 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.124184  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1853  transcription termination factor Rho  51.57 
 
 		 420 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.110087 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  52.3 
 
 		 418 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1740  transcription termination factor Rho  51.57 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318458  normal  0.139414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0949  transcription termination factor Rho  51.19 
 
 		 420 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.545356 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1855  transcription termination factor Rho  51.57 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2118  transcription termination factor Rho  51.2 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299268  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  51.79 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2402  transcription termination factor Rho  55.71 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2217  transcription termination factor Rho  51.81 
 
 		 420 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0809447  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2248  transcription termination factor Rho  51.81 
 
 		 420 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.336797  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1126  transcription termination factor Rho  51.57 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722702  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  50.95 
 
 		 419 aa  425  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  52.3 
 
 		 418 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2210  transcription termination factor Rho  51.81 
 
 		 420 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>