More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_89465 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009370  OSTLU_89465  predicted protein  100 
 
 
287 aa  566  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1442  pseudouridine synthase  47.39 
 
 
230 aa  204  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.012114  normal  0.792542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3469  pseudouridine synthase, Rsu  49.08 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0728  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.22 
 
 
237 aa  193  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.101731  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2010  pseudouridine synthase, Rsu  42.92 
 
 
228 aa  186  5e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3452  pseudouridine synthase  46.9 
 
 
246 aa  185  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33811  normal  0.805038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2704  pseudouridine synthase  44.02 
 
 
245 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.960401  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2175  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  42.92 
 
 
251 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1833  pseudouridine synthase  42.92 
 
 
237 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.498087  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2552  pseudouridine synthase  43.33 
 
 
242 aa  175  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0981088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2277  pseudouridine synthase  44.55 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0349808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2237  pseudouridine synthase  43.59 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2105  pseudouridine synthase  44.64 
 
 
244 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00908459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1080  pseudouridine synthase  45.3 
 
 
247 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.699986  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2235  pseudouridine synthase  44.84 
 
 
242 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.7178  normal  0.112154 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0541  ribosomal small subunit pseudouridine synthase  40.93 
 
 
236 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504782  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0478  pseudouridine synthase  41.3 
 
 
236 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03083  ribosomal small subunit pseudouridylate synthase  44.38 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1919  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  36.25 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000207089  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2352  16S rRNA pseudouridylate synthase A  40.09 
 
 
232 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1241  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  39.57 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000134561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2779  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.53 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480199  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1220  pseudouridine synthase  32.48 
 
 
233 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2975  pseudouridine synthase  38.53 
 
 
230 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0220169  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2744  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  36.64 
 
 
238 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0704  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  36.24 
 
 
251 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1807  pseudouridine synthase  34.76 
 
 
240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2171  pseudouridine synthase  35.71 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100732  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2614  pseudouridine synthase, Rsu  39.13 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.736823 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02113  16S rRNA pseudouridylate 516 synthase  38.63 
 
 
231 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1474  pseudouridine synthase  38.63 
 
 
231 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3321  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.63 
 
 
231 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0340688  normal  0.608364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02072  hypothetical protein  38.63 
 
 
231 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2321  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.63 
 
 
231 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2332  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.63 
 
 
231 aa  126  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531797  normal  0.0465983 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2481  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.63 
 
 
231 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0457418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1464  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.63 
 
 
231 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00167101  normal  0.759434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1639  16S rRNA pseudouridylate synthase A  36.75 
 
 
231 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0779  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  36.97 
 
 
240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2438  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.5 
 
 
232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1910  16S rRNA pseudouridylate synthase A  36.75 
 
 
231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.800741  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2718  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.5 
 
 
235 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00684404  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0183  pseudouridine synthase  39.44 
 
 
257 aa  126  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000206046  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0775  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.63 
 
 
231 aa  126  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.329505  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2793  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.5 
 
 
235 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.863598  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1490  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.5 
 
 
235 aa  125  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2018  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A (16S pseudouridine 516 synthase)  37.23 
 
 
234 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.136483  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0451  pseudouridine synthase  42.19 
 
 
233 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2249  16S pseudouridylate synthase  35.47 
 
 
239 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4413  putative ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  35.91 
 
 
240 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2546  16S pseudouridylate synthase  35.04 
 
 
239 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0379  pseudouridine synthase  33.18 
 
 
241 aa  124  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3369  pseudouridine synthase  36.21 
 
 
242 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1808  pseudouridine synthase  30.51 
 
 
231 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1843  pseudouridine synthase  30.51 
 
 
231 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.48228  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1103  pseudouridine synthase  38.83 
 
 
245 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3252  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.9 
 
 
237 aa  122  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.274461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4848  RNA pseudouridylate synthase family protein  34.48 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4438  pseudouridylate synthase (ribosomal small subunit pseudouridine synthase A)  34.48 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4841  RNA pseudouridine synthase family protein  34.48 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1183  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  39.88 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.471915 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4958  RNA pseudouridine synthase family protein  34.48 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4456  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  34.48 
 
 
242 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1744  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  34.87 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00693564  normal  0.573112 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1222  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase related pseudouridylate synthase  35.32 
 
 
245 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000251934  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4818  RNA pseudouridine synthase family protein  35 
 
 
242 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0418  RNA pseudouridine synthase family protein  34.48 
 
 
242 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.12702  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0593  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  35.04 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000243633  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0801  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A, putative  33.91 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0182974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4823  RNA pseudouridine synthase family protein  34.48 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02655  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  37.45 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0566  pseudouridine synthase  39.44 
 
 
248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472226  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3176  pseudouridine synthase  37.33 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2791  pseudouridine synthase  37.44 
 
 
240 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0832  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  35.86 
 
 
261 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190821  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0618  pseudouridine synthase  40 
 
 
248 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1626  pseudouridine synthase  34.05 
 
 
249 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126651  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0375  pseudouridine synthase  32.27 
 
 
241 aa  119  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4537  pseudouridine synthase  35 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2573  16S rRNA pseudouridylate synthase A  36.8 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  hitchhiker  0.00365879 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2416  16S rRNA pseudouridylate synthase A  36.8 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0365053  normal  0.123384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3730  pseudouridine synthase  36.09 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754242  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2462  16S rRNA pseudouridylate synthase A  36.8 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.983555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2371  16S rRNA pseudouridylate synthase A  36.8 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000147517  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0792  pseudouridine synthase  36.24 
 
 
229 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003781  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  36.6 
 
 
233 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000946261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3602  pseudouridine synthase  35.65 
 
 
231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2562  pseudouridine synthase, Rsu  34.19 
 
 
229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3507  pseudouridine synthase  37.1 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107621  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2459  16S rRNA pseudouridylate synthase A  36.36 
 
 
231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.8368  hitchhiker  0.0000353867 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0788  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  35.93 
 
 
235 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0198055  normal  0.495021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0736  pseudouridine synthase  39.09 
 
 
245 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000262919  decreased coverage  0.00132516 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3527  pseudouridine synthase  33.03 
 
 
230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0423129  hitchhiker  0.000538559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0843  pseudouridine synthase, Rsu  35.48 
 
 
229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3219  pseudouridine synthase  33.47 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0760  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  35.78 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000225375  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3714  pseudouridine synthase, Rsu  32.64 
 
 
249 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3178  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  35.5 
 
 
235 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.021025  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2758  pseudouridine synthase  36.82 
 
 
240 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0674  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A protein  39.68 
 
 
252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>