213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2970 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  100 
 
 		 382 aa  753    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  48.64 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.09 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.32 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.85 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  41.6 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.7 
 
 		 366 aa  222  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  39.89 
 
 		 861 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  40.75 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  40.75 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  39.67 
 
 		 408 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.42 
 
 		 373 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  38.17 
 
 		 837 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  43.25 
 
 		 369 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.51 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.22 
 
 		 357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  39.14 
 
 		 865 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  40.22 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.46 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  38.52 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.62 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.96 
 
 		 390 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  42.03 
 
 		 365 aa  189  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.97 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  42.77 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  38.57 
 
 		 370 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.62 
 
 		 392 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.24 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.68 
 
 		 383 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  35.9 
 
 		 850 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.48 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.83 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.67 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  27.95 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  27.95 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  26.85 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  25.21 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  29.59 
 
 		 376 aa  144  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.29 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.97 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  25.14 
 
 		 365 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  24.93 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.54 
 
 		 366 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  34.01 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  31.99 
 
 		 359 aa  136  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.54 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.41 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  26.23 
 
 		 390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  30.36 
 
 		 376 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.89 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.71 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.89 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.06 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  31.97 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  28.05 
 
 		 378 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.68 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  30.57 
 
 		 375 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  28.84 
 
 		 378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.97 
 
 		 372 aa  120  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.67 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  29.52 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.67 
 
 		 401 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.13 
 
 		 389 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.18 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  30.83 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  28.27 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  24.74 
 
 		 387 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.91 
 
 		 375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.69 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.22 
 
 		 375 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  27.11 
 
 		 371 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  26.36 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.26 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  30.86 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.55 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  28.25 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  28.22 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  30.3 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  24.24 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  23.97 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.97 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  23.97 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.08 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  23.97 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  23.97 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.53 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  23.97 
 
 		 372 aa  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  30.52 
 
 		 384 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  28.23 
 
 		 383 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  27.15 
 
 		 383 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  23.69 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.34 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  27.73 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.18 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.93 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.38 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  22.7 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.16 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.95 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  26.88 
 
 		 380 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>