160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6634 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 366 aa  729    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  49.59 
 
 		 372 aa  318  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  49.17 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.9 
 
 		 390 aa  202  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  41.67 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.2 
 
 		 392 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  38.59 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  39 
 
 		 378 aa  186  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  39.27 
 
 		 386 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  37.08 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  37.08 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.06 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.71 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  34.65 
 
 		 837 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.11 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.87 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.08 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.96 
 
 		 386 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  33.24 
 
 		 861 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  34.37 
 
 		 865 aa  149  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.44 
 
 		 374 aa  146  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.08 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  36.22 
 
 		 369 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.07 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.61 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  34.54 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.5 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.8 
 
 		 371 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.15 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  30.23 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.64 
 
 		 368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  31.68 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  32.74 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.49 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  33.42 
 
 		 850 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  27.73 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  27.73 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  26.59 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.61 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  30.31 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  30.11 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  26.54 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.97 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.97 
 
 		 372 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  27.62 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  29.14 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.13 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.58 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.97 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  28.61 
 
 		 410 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.85 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  27.17 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.57 
 
 		 390 aa  99.8  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.28 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.49 
 
 		 362 aa  97.4  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.44 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.49 
 
 		 401 aa  96.3  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  29.51 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  31.78 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  29.71 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.99 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  28.09 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.58 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  29.54 
 
 		 408 aa  94  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.58 
 
 		 375 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  30.9 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  28.13 
 
 		 382 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  29.66 
 
 		 383 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  27.36 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.87 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  23.53 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  24.62 
 
 		 383 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  24.42 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.27 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  29.66 
 
 		 383 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  28.82 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  30.04 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.56 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.27 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  26.69 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  29.66 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  29.81 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  29.81 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.32 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  29.38 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  29.38 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.67 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  23.61 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  23.61 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  24.73 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  25.3 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  23.61 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  32.95 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  25.34 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  25.34 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  31.78 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  26.17 
 
 		 394 aa  79.3  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.38 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  25.38 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  28.96 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>