186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3529 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  100 
 
 		 370 aa  730    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  47.14 
 
 		 364 aa  299  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  47.14 
 
 		 364 aa  299  6e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  48.48 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.81 
 
 		 392 aa  293  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.87 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  48.27 
 
 		 378 aa  276  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  47.9 
 
 		 386 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  47.28 
 
 		 378 aa  266  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  49.86 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  47.61 
 
 		 365 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  46.26 
 
 		 390 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.11 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  44.26 
 
 		 865 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.94 
 
 		 363 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1816  carboxylate-amine ligase  46.13 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.705931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  41.78 
 
 		 861 aa  235  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.8 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  43.09 
 
 		 837 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.67 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.75 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  44.8 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  43.01 
 
 		 369 aa  223  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.16 
 
 		 386 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.68 
 
 		 366 aa  216  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.86 
 
 		 409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6588  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.38 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  40.06 
 
 		 850 aa  209  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.16 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6634  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.67 
 
 		 366 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  36.39 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  32.05 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  31.51 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2177  glutamate--cysteine ligase GCS2  43.19 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  35.34 
 
 		 408 aa  196  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6613  glutamate--cysteine ligase GCS2  42.62 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  34.29 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  31.32 
 
 		 379 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  30.6 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  31.59 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  29.78 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  29.89 
 
 		 390 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  38.57 
 
 		 382 aa  179  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.3 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  33.24 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  35.18 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  33.06 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.18 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  32.88 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  34.76 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.78 
 
 		 390 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.39 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 		 360 aa  166  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  32.05 
 
 		 376 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.16 
 
 		 372 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.73 
 
 		 374 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.29 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  31.91 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  32.91 
 
 		 380 aa  156  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  33.55 
 
 		 380 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.24 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.97 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.99 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.69 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.95 
 
 		 374 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  32.32 
 
 		 382 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  34.81 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.69 
 
 		 374 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.58 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  31.3 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  31.3 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.37 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  31.3 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.41 
 
 		 362 aa  149  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.19 
 
 		 375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.59 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.71 
 
 		 380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  27.75 
 
 		 371 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.75 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  32.01 
 
 		 383 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  30.86 
 
 		 383 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.34 
 
 		 375 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  31.61 
 
 		 382 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.53 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  30.48 
 
 		 380 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.15 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  31.86 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  29.85 
 
 		 365 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.72 
 
 		 380 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  28.95 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  28.95 
 
 		 372 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.04 
 
 		 379 aa  139  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  28.66 
 
 		 372 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  28.44 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.44 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  28.44 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  28.44 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  28.44 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  28.65 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>