190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5194 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  92.53 
 
 		 375 aa  710    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  100 
 
 		 375 aa  762    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  93.07 
 
 		 375 aa  713    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  61.46 
 
 		 388 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  56.37 
 
 		 374 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  56.1 
 
 		 374 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  55.56 
 
 		 374 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  59.14 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  53.83 
 
 		 372 aa  401  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  47.71 
 
 		 389 aa  350  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.68 
 
 		 377 aa  309  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  45.95 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  42.03 
 
 		 410 aa  289  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  43.67 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  37.74 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  39.18 
 
 		 378 aa  236  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  40.87 
 
 		 375 aa  235  9e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  36.51 
 
 		 376 aa  228  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  35.15 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  34.69 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  34.06 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.54 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.1 
 
 		 366 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  35.17 
 
 		 376 aa  206  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  30.81 
 
 		 366 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  31.61 
 
 		 365 aa  202  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  30.81 
 
 		 367 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  31.42 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  38.02 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  36.91 
 
 		 368 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.6 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  35.34 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  33.7 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.69 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.15 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.65 
 
 		 390 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  34.02 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  33.24 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  33.14 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  33.14 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  33.14 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  35.29 
 
 		 363 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  33.75 
 
 		 359 aa  166  9e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.22 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  31.25 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  32.55 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  32.92 
 
 		 399 aa  162  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  31.7 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.77 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.52 
 
 		 388 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.47 
 
 		 362 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.51 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.61 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  33.15 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.77 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.25 
 
 		 360 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.53 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  32.82 
 
 		 364 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  32.82 
 
 		 364 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36370  carboxylate-amine ligase  39.76 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201432  normal  0.850871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3119  carboxylate-amine ligase  35.57 
 
 		 378 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  32.44 
 
 		 376 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.39 
 
 		 371 aa  152  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.88 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  31.79 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  29.9 
 
 		 360 aa  150  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  31.16 
 
 		 383 aa  146  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  31.15 
 
 		 861 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  29.84 
 
 		 865 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  29.41 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  30.48 
 
 		 837 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  30.03 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  34.07 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.2 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.51 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.9 
 
 		 363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.13 
 
 		 378 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.78 
 
 		 392 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.25 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.07 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.06 
 
 		 357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  31.73 
 
 		 850 aa  129  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.23 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  27.27 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  31.68 
 
 		 386 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.91 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  26.84 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  26.33 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  28.91 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  30 
 
 		 369 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  27.08 
 
 		 374 aa  122  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  27.08 
 
 		 374 aa  122  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  26.18 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  26.69 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.8 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  26.9 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0584  carboxylate-amine ligase  26.81 
 
 		 374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  26.88 
 
 		 384 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.06 
 
 		 372 aa  119  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.78 
 
 		 398 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>