173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3119 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3119  carboxylate-amine ligase  100 
 
 		 378 aa  753    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36370  carboxylate-amine ligase  84.72 
 
 		 404 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201432  normal  0.850871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  46.79 
 
 		 373 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  43.84 
 
 		 378 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  44.13 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  44.41 
 
 		 368 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  36.17 
 
 		 378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  40 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  36.69 
 
 		 410 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.11 
 
 		 374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.84 
 
 		 372 aa  212  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.84 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  35.79 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.79 
 
 		 389 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.3 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  37.5 
 
 		 389 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.96 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.65 
 
 		 380 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.15 
 
 		 375 aa  192  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.88 
 
 		 375 aa  192  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  35.87 
 
 		 375 aa  190  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.75 
 
 		 377 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.45 
 
 		 377 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  36.79 
 
 		 861 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.86 
 
 		 366 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  28.95 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  31.86 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  28.76 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  29.82 
 
 		 379 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  35.85 
 
 		 865 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  32.77 
 
 		 837 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  32.61 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  31.06 
 
 		 365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.94 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  33.52 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  30.48 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  29.9 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  28.65 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.83 
 
 		 366 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  34.11 
 
 		 850 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  30 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  34.47 
 
 		 364 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  34.47 
 
 		 364 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.83 
 
 		 373 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.13 
 
 		 378 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.9 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  31.97 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  31.02 
 
 		 399 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.65 
 
 		 401 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  30.23 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.24 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  32.77 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.86 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.27 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.99 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  29.93 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  29.69 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3494  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.43 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  29.59 
 
 		 376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  29.59 
 
 		 376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  28 
 
 		 390 aa  129  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.62 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  30.61 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.44 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.75 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.28 
 
 		 378 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  31.67 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  28.57 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0126  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.4 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.81 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  28.22 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.1 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.66 
 
 		 374 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.92 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.23 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  28.28 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  29.58 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2448  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.76 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000845402  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  30.1 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  32.81 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  25.57 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.03 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  26.48 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  31.74 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  31.23 
 
 		 376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  28.18 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.33 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2310  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.24 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.59 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.62 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  29.23 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.5 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2802  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.64 
 
 		 372 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000177557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.17 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4929  carboxylate-amine ligase  34.03 
 
 		 365 aa  106  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825516  normal  0.0204197 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3493  carboxylate-amine ligase  26.37 
 
 		 377 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  25.98 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3168  carboxylate-amine ligase  26.03 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.95 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  26.91 
 
 		 374 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>