180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0952 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  100 
 
 		 359 aa  731    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  70.83 
 
 		 362 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  69.47 
 
 		 360 aa  508  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  69.19 
 
 		 360 aa  503  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  64.43 
 
 		 365 aa  475  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.03 
 
 		 366 aa  205  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  34.87 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  36.52 
 
 		 363 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  35.47 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  32.77 
 
 		 390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  32.11 
 
 		 385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.98 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  33.71 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  35.36 
 
 		 376 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  35.36 
 
 		 376 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  35.36 
 
 		 376 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  34.8 
 
 		 384 aa  176  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  30.9 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.4 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  34.08 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  30.31 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  36.77 
 
 		 382 aa  173  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.6 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.7 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  30.59 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  31.46 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.99 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.68 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  35.15 
 
 		 382 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.75 
 
 		 375 aa  166  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.24 
 
 		 379 aa  166  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  33.7 
 
 		 376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.42 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  33.62 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  35.74 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.41 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  30.73 
 
 		 379 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.22 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  32.15 
 
 		 380 aa  160  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.44 
 
 		 372 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.89 
 
 		 375 aa  159  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.33 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.91 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.59 
 
 		 378 aa  156  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  31.27 
 
 		 378 aa  155  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  33.23 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  35.31 
 
 		 398 aa  152  8e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.05 
 
 		 384 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.89 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.05 
 
 		 388 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.89 
 
 		 374 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  31.27 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.06 
 
 		 381 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  31.77 
 
 		 389 aa  149  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.29 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  31.55 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  31.9 
 
 		 375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.53 
 
 		 374 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  30.54 
 
 		 410 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.11 
 
 		 380 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.85 
 
 		 380 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0270  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.29 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.326062  hitchhiker  0.00150458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.04 
 
 		 378 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  30.87 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  31.6 
 
 		 364 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  31.6 
 
 		 364 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  32.51 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  30.6 
 
 		 837 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3015  carboxylate-amine ligase  31.73 
 
 		 373 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  31.15 
 
 		 408 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  32.27 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  31.99 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3253  carboxylate-amine ligase  32.21 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  30.93 
 
 		 861 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  30.14 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  22.86 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  30.3 
 
 		 865 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  22.86 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.68 
 
 		 409 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  34.2 
 
 		 850 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  26.58 
 
 		 371 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  26.58 
 
 		 371 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.13 
 
 		 392 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  26.58 
 
 		 371 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  26.58 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  28.66 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  35.12 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.7 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  26.27 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  26.27 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  28.77 
 
 		 376 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  30.06 
 
 		 378 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  27.71 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.37 
 
 		 386 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  28.4 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0001  carboxylate-amine ligase  25.96 
 
 		 415 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  28.4 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  28.61 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  28.61 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  28.81 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>