187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4053 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  100 
 
 		 367 aa  769    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  69.42 
 
 		 366 aa  548  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  63.74 
 
 		 365 aa  488  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  61.75 
 
 		 366 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  54.57 
 
 		 385 aa  432  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  53.19 
 
 		 390 aa  411  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  53.19 
 
 		 379 aa  408  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  53.74 
 
 		 379 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  42.69 
 
 		 375 aa  283  5.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  41.23 
 
 		 378 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.5 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  38.44 
 
 		 389 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  37.32 
 
 		 376 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  34.44 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.39 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.87 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  34.06 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.53 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  34.52 
 
 		 382 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  36.21 
 
 		 363 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.26 
 
 		 379 aa  223  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.96 
 
 		 374 aa  222  7e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.69 
 
 		 374 aa  222  7e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.42 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  35.01 
 
 		 382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.5 
 
 		 390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.51 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.08 
 
 		 375 aa  216  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  33.98 
 
 		 383 aa  215  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  35.91 
 
 		 383 aa  215  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.81 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  33.61 
 
 		 376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.81 
 
 		 375 aa  212  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  33.89 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  34.44 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.3 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.23 
 
 		 384 aa  209  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  33.89 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  33.89 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  33.89 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  31.87 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.06 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.24 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.01 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  31.88 
 
 		 383 aa  202  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.56 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.83 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  32.79 
 
 		 376 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.77 
 
 		 388 aa  199  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  31.87 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.32 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.06 
 
 		 379 aa  195  9e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.28 
 
 		 362 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  32.46 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  32.94 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  30.05 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  31.77 
 
 		 384 aa  185  9e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.75 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  28.22 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  28.22 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  29.81 
 
 		 865 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  31.81 
 
 		 378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  29.79 
 
 		 373 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.23 
 
 		 382 aa  179  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  33.33 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  29.59 
 
 		 837 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.83 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  30.42 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  30.42 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  26.42 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0741  carboxylate-amine ligase  30.42 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  31.25 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  30.42 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  26.14 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  28.41 
 
 		 861 aa  175  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.8 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.61 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0679  carboxylate-amine ligase  30.12 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.308849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  29.4 
 
 		 378 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.28 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.57 
 
 		 378 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  31.83 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  29.22 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3020  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.72 
 
 		 409 aa  169  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  29.22 
 
 		 372 aa  169  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  29.22 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.22 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  29.22 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  29.22 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  26.99 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  28.92 
 
 		 372 aa  166  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0476  carboxylate-amine ligase  31.14 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.59 
 
 		 390 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9080  uncharacterized enzyme  29.75 
 
 		 386 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.9 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  28.53 
 
 		 387 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.61 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  27.86 
 
 		 370 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  27.96 
 
 		 374 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  28.45 
 
 		 384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>