162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0599 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  99.19 
 
 		 372 aa  775    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  99.19 
 
 		 372 aa  775    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  84.1 
 
 		 372 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  98.92 
 
 		 372 aa  773    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  99.19 
 
 		 372 aa  775    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0679  carboxylate-amine ligase  84.1 
 
 		 372 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.308849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  98.92 
 
 		 372 aa  773    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  99.19 
 
 		 372 aa  775    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  99.19 
 
 		 372 aa  775    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  100 
 
 		 372 aa  781    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0476  carboxylate-amine ligase  99.07 
 
 		 327 aa  673    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  84.1 
 
 		 372 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  84.37 
 
 		 372 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0741  carboxylate-amine ligase  84.37 
 
 		 372 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  77.3 
 
 		 373 aa  619  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  46.07 
 
 		 371 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2917  carboxylate-amine ligase  46.07 
 
 		 371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0214  carboxylate-amine ligase  46.07 
 
 		 371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0001  carboxylate-amine ligase  46.07 
 
 		 415 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3394  carboxylate-amine ligase  46.07 
 
 		 371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1626  carboxylate-amine ligase  46.07 
 
 		 371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0001  carboxylate-amine ligase  46.07 
 
 		 371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0001  carboxylate-amine ligase  46.07 
 
 		 371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2975  carboxylate-amine ligase  46.07 
 
 		 371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  45.8 
 
 		 371 aa  358  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  45.8 
 
 		 371 aa  358  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  46.36 
 
 		 372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  45.53 
 
 		 371 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  45.53 
 
 		 371 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  45.53 
 
 		 371 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  45.53 
 
 		 371 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  45.53 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  45.53 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  46.76 
 
 		 377 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0069  carboxylate-amine ligase  44.99 
 
 		 371 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  44.74 
 
 		 374 aa  346  4e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  44.47 
 
 		 371 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5194  carboxylate-amine ligase  43.9 
 
 		 375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  42.66 
 
 		 374 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  44 
 
 		 374 aa  335  9e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  44 
 
 		 374 aa  335  9e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3493  carboxylate-amine ligase  45.8 
 
 		 377 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3168  carboxylate-amine ligase  45.53 
 
 		 377 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  43.68 
 
 		 376 aa  332  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  41.51 
 
 		 379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0584  carboxylate-amine ligase  42.86 
 
 		 374 aa  325  7e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  39.25 
 
 		 383 aa  322  9.000000000000001e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  39.89 
 
 		 381 aa  319  6e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  39.25 
 
 		 383 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  41.38 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  41.13 
 
 		 371 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  42.7 
 
 		 370 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0668  carboxylate-amine ligase  40.16 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0652  carboxylate-amine ligase  40.16 
 
 		 373 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  39.5 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  32.14 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.7 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.42 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  33.83 
 
 		 382 aa  199  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.49 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  30.58 
 
 		 382 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.18 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  35.12 
 
 		 379 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  30.11 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.82 
 
 		 366 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  32.08 
 
 		 379 aa  182  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  30.08 
 
 		 376 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  30.13 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.73 
 
 		 379 aa  177  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  31.16 
 
 		 366 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  30.52 
 
 		 390 aa  176  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  31.45 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.34 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.42 
 
 		 390 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  32.43 
 
 		 383 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  29.03 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  30.08 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  29.55 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  30.58 
 
 		 380 aa  169  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  29.7 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  29.7 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.27 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  31.49 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  29.07 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.64 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  29.88 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  29.43 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  29.18 
 
 		 376 aa  165  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  27.38 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  30.46 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  28.87 
 
 		 376 aa  160  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  27.73 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  28.85 
 
 		 363 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.3 
 
 		 388 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  30.12 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.34 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  27.68 
 
 		 837 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  29.97 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.16 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>