192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0030 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  100 
 
 		 376 aa  768    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  41.96 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  45.26 
 
 		 363 aa  292  6e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  39.39 
 
 		 379 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  39.51 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  38.72 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  38.8 
 
 		 385 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.03 
 
 		 366 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  38.86 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  34.44 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.39 
 
 		 390 aa  239  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  40.97 
 
 		 401 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.77 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  35.25 
 
 		 365 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  33.43 
 
 		 366 aa  235  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  39.62 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  39.35 
 
 		 383 aa  232  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  38.27 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  38.32 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  37.19 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.89 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.38 
 
 		 389 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.17 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  37.26 
 
 		 380 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  36.54 
 
 		 376 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  36.54 
 
 		 376 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  36.54 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.6 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  36.76 
 
 		 383 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1911  carboxylate-amine ligase  33.52 
 
 		 378 aa  215  8e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.72 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  35.99 
 
 		 376 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.83 
 
 		 379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  36.04 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  39.66 
 
 		 398 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  36.87 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.85 
 
 		 381 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  34.32 
 
 		 380 aa  206  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.17 
 
 		 375 aa  206  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1633  carboxylate-amine ligase  32.97 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.816499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3702  carboxylate-amine ligase  35.66 
 
 		 376 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0961224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.52 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.85 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  32.86 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.43 
 
 		 360 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5116  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.2 
 
 		 375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.2 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  34.87 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.14 
 
 		 374 aa  193  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  34.63 
 
 		 365 aa  192  8e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.09 
 
 		 362 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  38.01 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.81 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.87 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.06 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1749  carboxylate-amine ligase  32.65 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.589468  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  28.49 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  28.77 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  31.59 
 
 		 410 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  33.54 
 
 		 374 aa  180  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1127  hypothetical protein  34.14 
 
 		 384 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.118278  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4470  carboxylate-amine ligase  31.04 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0434  carboxylate-amine ligase  30.29 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307001  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1085  carboxylate-amine ligase  29.67 
 
 		 373 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.571771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  33.92 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.76 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0718  carboxylate-amine ligase  30 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  29.8 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0584  carboxylate-amine ligase  31.1 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.334694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  32.15 
 
 		 865 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4460  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 		 364 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0697094  normal  0.0368426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4754  carboxylate-amine ligase  33.33 
 
 		 364 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  31.28 
 
 		 861 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3485  carboxylate-amine ligase  30.86 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0622  carboxylate-amine ligase  29.78 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3664  carboxylate-amine ligase  29.78 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0357  carboxylate-amine ligase  30.72 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0636  carboxylate-amine ligase  29.49 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  30.55 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0695  carboxylate-amine ligase  29.3 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0741  carboxylate-amine ligase  29.3 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0346  carboxylate-amine ligase  30.42 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221687  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0679  carboxylate-amine ligase  29.01 
 
 		 372 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.308849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  29.73 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  34.15 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.44 
 
 		 378 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0600  carboxylate-amine ligase  29.18 
 
 		 372 aa  167  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  32.06 
 
 		 370 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  29.55 
 
 		 371 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0662  carboxylate-amine ligase  29.18 
 
 		 372 aa  166  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00542  gamma-glutamyl:cysteine ligase  28.9 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3048  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.9 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00531  hypothetical protein  28.9 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  31.53 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0599  carboxylate-amine ligase  29.18 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3065  carboxylate-amine ligase  28.9 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0628  carboxylate-amine ligase  28.9 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  29.07 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  32.69 
 
 		 850 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  29.02 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>