More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3532 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  48 
 
 		 850 aa  639    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  53.37 
 
 		 861 aa  829    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3532  hypothetical protein  100 
 
 		 837 aa  1640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  56.18 
 
 		 865 aa  830    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  43.03 
 
 		 567 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  43.03 
 
 		 567 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  43.03 
 
 		 567 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5101  protein of unknown function DUF404  45.13 
 
 		 489 aa  335  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  44.56 
 
 		 518 aa  333  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  42.37 
 
 		 544 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  43.09 
 
 		 519 aa  332  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  45.93 
 
 		 553 aa  330  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  42.03 
 
 		 477 aa  330  8e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  44.14 
 
 		 520 aa  329  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  41.2 
 
 		 478 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2799  protein of unknown function DUF404  43.66 
 
 		 553 aa  324  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991145  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  42.64 
 
 		 471 aa  325  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  46.04 
 
 		 526 aa  323  7e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  42.06 
 
 		 498 aa  321  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  43.45 
 
 		 606 aa  321  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  40.73 
 
 		 518 aa  317  7e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  40.17 
 
 		 497 aa  315  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  38.99 
 
 		 480 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  38.82 
 
 		 479 aa  314  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  42.95 
 
 		 488 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  41.58 
 
 		 482 aa  312  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  39.91 
 
 		 492 aa  312  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  38.6 
 
 		 479 aa  312  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11431  hypothetical protein  38.61 
 
 		 480 aa  312  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11421  hypothetical protein  38.39 
 
 		 480 aa  311  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  41.83 
 
 		 472 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  43.01 
 
 		 476 aa  311  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  42 
 
 		 473 aa  311  4e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  40.61 
 
 		 486 aa  311  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1049  hypothetical protein  38.61 
 
 		 480 aa  310  5.9999999999999995e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  40 
 
 		 472 aa  310  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2221  protein of unknown function DUF404  45.85 
 
 		 526 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  42.24 
 
 		 551 aa  310  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  41.48 
 
 		 469 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  42.67 
 
 		 476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3242  protein of unknown function DUF404  40.13 
 
 		 475 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.657698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  39.91 
 
 		 482 aa  308  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  42.12 
 
 		 476 aa  308  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  41.04 
 
 		 480 aa  308  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  43.55 
 
 		 552 aa  307  5.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  41.19 
 
 		 469 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  41.27 
 
 		 469 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  41.04 
 
 		 480 aa  307  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  41.01 
 
 		 489 aa  307  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  41.96 
 
 		 469 aa  307  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  39.75 
 
 		 482 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4571  protein of unknown function DUF404  41.96 
 
 		 545 aa  306  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0733  hypothetical protein  39.52 
 
 		 476 aa  306  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.195741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  40.43 
 
 		 487 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  40.84 
 
 		 501 aa  305  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  39.79 
 
 		 472 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  38.33 
 
 		 479 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  41.47 
 
 		 494 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  43.53 
 
 		 507 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  39.52 
 
 		 479 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  39.87 
 
 		 470 aa  305  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  43.05 
 
 		 539 aa  305  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2474  hypothetical protein  39.96 
 
 		 515 aa  304  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  40 
 
 		 472 aa  304  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  38.46 
 
 		 470 aa  303  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  38.46 
 
 		 482 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  40.82 
 
 		 494 aa  303  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  38.62 
 
 		 477 aa  303  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  40.08 
 
 		 472 aa  303  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  40.6 
 
 		 518 aa  302  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  38.7 
 
 		 476 aa  302  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2484  protein of unknown function DUF404  38.2 
 
 		 479 aa  302  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  39.09 
 
 		 482 aa  302  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3519  hypothetical protein  38.68 
 
 		 476 aa  302  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2208  hypothetical protein  38.2 
 
 		 479 aa  302  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  40.91 
 
 		 507 aa  301  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4002  hypothetical protein  38.68 
 
 		 471 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1815  hypothetical protein  40.56 
 
 		 479 aa  301  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.02256  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2676  hypothetical protein  40.04 
 
 		 475 aa  301  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.508929 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  40.48 
 
 		 470 aa  301  4e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  40.72 
 
 		 477 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  40.88 
 
 		 469 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  38.68 
 
 		 476 aa  300  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0404  hypothetical protein  40.26 
 
 		 485 aa  300  7e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  39.39 
 
 		 479 aa  300  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  39.1 
 
 		 482 aa  300  8e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  39.39 
 
 		 479 aa  300  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  42.27 
 
 		 480 aa  299  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2264  hypothetical protein  39.34 
 
 		 502 aa  298  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  39.44 
 
 		 471 aa  298  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15711  hypothetical protein  40 
 
 		 477 aa  298  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.144096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  39.32 
 
 		 469 aa  298  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2205  protein of unknown function DUF404  43.1 
 
 		 544 aa  298  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320097  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4106  hypothetical protein  38.68 
 
 		 471 aa  298  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  39.1 
 
 		 491 aa  298  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  41.3 
 
 		 488 aa  298  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  38.28 
 
 		 501 aa  298  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1781  hypothetical protein  38.68 
 
 		 471 aa  298  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2041  hypothetical protein  38.68 
 
 		 477 aa  298  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00170326  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  38.68 
 
 		 478 aa  298  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>