237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3276 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  73.36 
 
 		 480 aa  720    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  963    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  72.63 
 
 		 488 aa  721    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  92.02 
 
 		 476 aa  895    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  74.53 
 
 		 488 aa  691    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  63.47 
 
 		 482 aa  627  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  63.05 
 
 		 482 aa  624  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  62.74 
 
 		 482 aa  622  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  61.8 
 
 		 482 aa  615  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  60.13 
 
 		 482 aa  617  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  60.96 
 
 		 482 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  64.53 
 
 		 507 aa  613  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  59.83 
 
 		 501 aa  590  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  59.2 
 
 		 480 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  59.87 
 
 		 477 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  58.99 
 
 		 480 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  58.56 
 
 		 480 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  58.14 
 
 		 476 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  57.93 
 
 		 501 aa  568  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  58.19 
 
 		 488 aa  568  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  56.84 
 
 		 482 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  57.87 
 
 		 470 aa  556  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  58.46 
 
 		 487 aa  554  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  58.99 
 
 		 518 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  57.17 
 
 		 498 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  57.92 
 
 		 491 aa  545  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  58.7 
 
 		 494 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  58.57 
 
 		 494 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  54.41 
 
 		 486 aa  545  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  56.87 
 
 		 518 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1676  protein of unknown function DUF404  54.83 
 
 		 482 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  56.75 
 
 		 481 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  58.94 
 
 		 476 aa  544  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  58.13 
 
 		 507 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  58.23 
 
 		 477 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  55.65 
 
 		 497 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  58.46 
 
 		 469 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  57.69 
 
 		 471 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  57.08 
 
 		 473 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  58.67 
 
 		 469 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  57.3 
 
 		 489 aa  538  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  55.79 
 
 		 482 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  56.78 
 
 		 478 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  58.24 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  57.27 
 
 		 490 aa  538  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  57.62 
 
 		 487 aa  535  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  55.96 
 
 		 472 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  57.39 
 
 		 469 aa  537  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  56.65 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  56.01 
 
 		 469 aa  532  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  56.22 
 
 		 494 aa  534  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  56.65 
 
 		 469 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  58.07 
 
 		 489 aa  534  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  56.17 
 
 		 489 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  53.85 
 
 		 488 aa  533  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  56.54 
 
 		 490 aa  532  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  57.41 
 
 		 487 aa  533  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  56.01 
 
 		 469 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  57.85 
 
 		 471 aa  529  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2474  hypothetical protein  56.69 
 
 		 515 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813576  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  55.74 
 
 		 472 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  57.6 
 
 		 470 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0404  hypothetical protein  57.05 
 
 		 485 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  56.22 
 
 		 469 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  57.6 
 
 		 472 aa  526  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  55.58 
 
 		 479 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  53.04 
 
 		 481 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  54.39 
 
 		 492 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  55.36 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  55.74 
 
 		 472 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  55.79 
 
 		 469 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  55.11 
 
 		 472 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  54.08 
 
 		 479 aa  521  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1312  protein of unknown function DUF404  55.13 
 
 		 480 aa  523  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11431  hypothetical protein  53.99 
 
 		 480 aa  521  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  56.96 
 
 		 470 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  55.58 
 
 		 479 aa  522  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0990  hypothetical protein  54.29 
 
 		 484 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2484  protein of unknown function DUF404  56.89 
 
 		 479 aa  519  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  55.49 
 
 		 479 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2208  hypothetical protein  56.89 
 
 		 479 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11421  hypothetical protein  53.78 
 
 		 480 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  56.36 
 
 		 479 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1049  hypothetical protein  53.57 
 
 		 480 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  56.44 
 
 		 526 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2799  protein of unknown function DUF404  53.86 
 
 		 553 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991145  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  54.91 
 
 		 482 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0519  hypothetical protein  55.96 
 
 		 481 aa  510  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  54.7 
 
 		 567 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  55.16 
 
 		 479 aa  510  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  54.7 
 
 		 567 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  53.05 
 
 		 488 aa  510  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  54.7 
 
 		 567 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  54.94 
 
 		 553 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2905  hypothetical protein  54.76 
 
 		 487 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2264  hypothetical protein  54.39 
 
 		 502 aa  503  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2522  protein of unknown function DUF404  54.76 
 
 		 487 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  53.42 
 
 		 470 aa  501  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  54.08 
 
 		 519 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  53.43 
 
 		 544 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>