237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17370 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1091    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2221  protein of unknown function DUF404  65.26 
 
 
526 aa  620  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  65.74 
 
 
518 aa  619  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  64.52 
 
 
520 aa  617  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2205  protein of unknown function DUF404  67.16 
 
 
544 aa  584  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320097  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2799  protein of unknown function DUF404  62.47 
 
 
553 aa  582  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  60.87 
 
 
606 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  60.99 
 
 
544 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  63.17 
 
 
526 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  61.42 
 
 
519 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  58.75 
 
 
567 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  58.75 
 
 
567 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  58.75 
 
 
567 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  62.28 
 
 
553 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4571  protein of unknown function DUF404  56.5 
 
 
545 aa  555  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  58.47 
 
 
551 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  55.39 
 
 
539 aa  495  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  54.39 
 
 
488 aa  488  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  52.04 
 
 
487 aa  483  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  51.04 
 
 
489 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  53.7 
 
 
489 aa  477  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  53 
 
 
473 aa  475  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  48.33 
 
 
488 aa  476  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  52.26 
 
 
472 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  52.69 
 
 
488 aa  475  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  52.68 
 
 
469 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  52.14 
 
 
472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1815  hypothetical protein  52.14 
 
 
479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.02256  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  53.55 
 
 
470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  52.69 
 
 
470 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  53.12 
 
 
469 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  50.75 
 
 
472 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  51.4 
 
 
472 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  49.39 
 
 
501 aa  466  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  51.89 
 
 
476 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  50.85 
 
 
469 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  51.07 
 
 
469 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  50.64 
 
 
469 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  50.43 
 
 
486 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  53.65 
 
 
489 aa  464  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  50.2 
 
 
518 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  51.74 
 
 
479 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  51.83 
 
 
494 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  48.55 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  49.57 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  53.88 
 
 
497 aa  460  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  51.26 
 
 
476 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2676  hypothetical protein  50.75 
 
 
475 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.508929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  50 
 
 
498 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  50.54 
 
 
471 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  48.64 
 
 
476 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  51.42 
 
 
479 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  52.26 
 
 
469 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  46.73 
 
 
479 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  52.04 
 
 
469 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  51.61 
 
 
471 aa  458  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  50.43 
 
 
469 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1312  protein of unknown function DUF404  49.9 
 
 
480 aa  457  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  48.85 
 
 
501 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  49.9 
 
 
518 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  53.12 
 
 
487 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  50.64 
 
 
476 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  50.54 
 
 
470 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  50.22 
 
 
479 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  47.35 
 
 
479 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  48.35 
 
 
492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  50.43 
 
 
482 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  50.22 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  50.11 
 
 
477 aa  455  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  49.15 
 
 
480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  48.84 
 
 
480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  47.79 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  51.36 
 
 
507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  52.9 
 
 
487 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  48.61 
 
 
480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  48.48 
 
 
497 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  51.18 
 
 
482 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3052  hypothetical protein  48.24 
 
 
482 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  48.72 
 
 
480 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  53.79 
 
 
490 aa  448  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  49.79 
 
 
470 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2208  hypothetical protein  49.78 
 
 
479 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  49.68 
 
 
470 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  46.49 
 
 
481 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  49.79 
 
 
482 aa  449  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  48.28 
 
 
482 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  50.11 
 
 
464 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2484  protein of unknown function DUF404  49.78 
 
 
479 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  48.94 
 
 
503 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  50.75 
 
 
469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  50.21 
 
 
477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  49.9 
 
 
488 aa  448  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  48.71 
 
 
477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  48.82 
 
 
469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3166  protein of unknown function DUF404  48.39 
 
 
469 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.839276  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  47.72 
 
 
482 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0519  hypothetical protein  48.8 
 
 
481 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0399  hypothetical protein  51.13 
 
 
484 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  49.89 
 
 
478 aa  445  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  50.32 
 
 
469 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>