238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4571 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  62.19 
 
 
520 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4571  protein of unknown function DUF404  100 
 
 
545 aa  1108    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  63.83 
 
 
518 aa  661    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  64.3 
 
 
526 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  63.44 
 
 
567 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  61.41 
 
 
606 aa  609  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  63.44 
 
 
567 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  63.44 
 
 
567 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  63.05 
 
 
553 aa  606  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  62.15 
 
 
544 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  61.94 
 
 
519 aa  601  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2799  protein of unknown function DUF404  62.58 
 
 
553 aa  601  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991145  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2221  protein of unknown function DUF404  64.51 
 
 
526 aa  594  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  59.43 
 
 
551 aa  592  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2205  protein of unknown function DUF404  62.18 
 
 
544 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320097  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  56.5 
 
 
552 aa  555  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  51.07 
 
 
481 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  52.42 
 
 
476 aa  480  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  53.16 
 
 
488 aa  477  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  50.74 
 
 
488 aa  474  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  51.16 
 
 
476 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  50.54 
 
 
471 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  52.84 
 
 
497 aa  466  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  49.27 
 
 
482 aa  463  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  48.02 
 
 
482 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  50 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  50.64 
 
 
489 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  50.42 
 
 
480 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  50.73 
 
 
476 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  47.82 
 
 
482 aa  456  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  50.43 
 
 
472 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  48.28 
 
 
480 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  48.44 
 
 
482 aa  457  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  47.19 
 
 
482 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  50.84 
 
 
539 aa  458  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  51.59 
 
 
469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  47.45 
 
 
479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  49.57 
 
 
487 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  50.64 
 
 
507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  47.47 
 
 
480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  50.43 
 
 
472 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  50.21 
 
 
472 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  50 
 
 
472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  48.6 
 
 
480 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  48.42 
 
 
488 aa  451  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  45.51 
 
 
488 aa  451  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  47.43 
 
 
501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  50.74 
 
 
469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  50 
 
 
473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  50.53 
 
 
469 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  52.93 
 
 
490 aa  448  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  49.14 
 
 
494 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  49.46 
 
 
469 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  49.58 
 
 
477 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2636  hypothetical protein  49.48 
 
 
499 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1049  hypothetical protein  45.74 
 
 
480 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  48.29 
 
 
470 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1668  protein of unknown function DUF404  53.15 
 
 
508 aa  442  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.325623  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  49.35 
 
 
491 aa  445  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11431  hypothetical protein  45.95 
 
 
480 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1312  protein of unknown function DUF404  48.39 
 
 
480 aa  443  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  49.14 
 
 
494 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11421  hypothetical protein  45.53 
 
 
480 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  48.21 
 
 
478 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3052  hypothetical protein  49.89 
 
 
482 aa  438  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0733  hypothetical protein  46.86 
 
 
476 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.195741  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  49.57 
 
 
490 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  47.31 
 
 
477 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2264  hypothetical protein  48.23 
 
 
502 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  47.23 
 
 
479 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  47.51 
 
 
482 aa  435  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  49.14 
 
 
507 aa  438  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  49.06 
 
 
494 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  49.79 
 
 
471 aa  438  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  48.17 
 
 
469 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  47.78 
 
 
498 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1676  protein of unknown function DUF404  46.76 
 
 
482 aa  438  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  48.1 
 
 
476 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  49.69 
 
 
487 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  49.14 
 
 
489 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  49.37 
 
 
489 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  49.89 
 
 
470 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  47.37 
 
 
503 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  47.86 
 
 
482 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  49.69 
 
 
487 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  47.31 
 
 
492 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  48.64 
 
 
488 aa  438  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  48.07 
 
 
482 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  47.74 
 
 
469 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  49.25 
 
 
469 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  48.18 
 
 
486 aa  435  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  47.57 
 
 
518 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  48.39 
 
 
469 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  48.6 
 
 
469 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  49.36 
 
 
472 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  49.03 
 
 
470 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  47.53 
 
 
469 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  46.85 
 
 
518 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0404  hypothetical protein  48.14 
 
 
485 aa  432  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15711  hypothetical protein  46.96 
 
 
477 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.144096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>