240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2205 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2205  protein of unknown function DUF404  100 
 
 
544 aa  1084    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320097  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2221  protein of unknown function DUF404  72.57 
 
 
526 aa  728    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  64.26 
 
 
520 aa  666    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  63.5 
 
 
518 aa  657    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  68.83 
 
 
526 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  67.65 
 
 
552 aa  629  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  64.45 
 
 
606 aa  623  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  63.09 
 
 
544 aa  609  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  63.73 
 
 
519 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  62.34 
 
 
567 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  62.34 
 
 
567 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  62.34 
 
 
567 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4571  protein of unknown function DUF404  62.18 
 
 
545 aa  599  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2799  protein of unknown function DUF404  63.03 
 
 
553 aa  598  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  62.81 
 
 
553 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  63.23 
 
 
551 aa  595  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  55.22 
 
 
476 aa  509  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  53.33 
 
 
487 aa  506  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  53.09 
 
 
471 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  53.33 
 
 
473 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  54.37 
 
 
469 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  53.28 
 
 
478 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  53.73 
 
 
469 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  53.73 
 
 
469 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  54.43 
 
 
539 aa  491  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  52.54 
 
 
470 aa  489  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  50.1 
 
 
480 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  51.18 
 
 
479 aa  488  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  52.35 
 
 
472 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  52.22 
 
 
498 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  52.35 
 
 
489 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  51.48 
 
 
488 aa  487  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  51.5 
 
 
486 aa  486  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  58.55 
 
 
477 aa  488  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  53.6 
 
 
507 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  52.43 
 
 
518 aa  488  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  52.99 
 
 
469 aa  485  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  50.52 
 
 
482 aa  486  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  50.42 
 
 
497 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  53.12 
 
 
494 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  58.8 
 
 
489 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  50.62 
 
 
482 aa  483  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  54.16 
 
 
471 aa  484  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  52.14 
 
 
472 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  57.04 
 
 
491 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  48.02 
 
 
488 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  53.98 
 
 
470 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  51.71 
 
 
472 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  52.74 
 
 
488 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  53.55 
 
 
469 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  53.33 
 
 
469 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  48.76 
 
 
482 aa  481  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  50.96 
 
 
503 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  55.56 
 
 
479 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  55.32 
 
 
479 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  51.93 
 
 
470 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  50 
 
 
482 aa  480  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1815  hypothetical protein  52.79 
 
 
479 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.02256  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1312  protein of unknown function DUF404  50.42 
 
 
480 aa  481  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  49.9 
 
 
480 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0404  hypothetical protein  56.21 
 
 
485 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  53.55 
 
 
469 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  52.93 
 
 
494 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  51.47 
 
 
476 aa  477  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  54.37 
 
 
479 aa  478  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  51.28 
 
 
472 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  51.95 
 
 
490 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  49.48 
 
 
480 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  53.33 
 
 
470 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  52.62 
 
 
489 aa  476  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  52.97 
 
 
518 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  50.63 
 
 
501 aa  477  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  48.13 
 
 
482 aa  476  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  52.88 
 
 
494 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  50.97 
 
 
469 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  52.21 
 
 
507 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1668  protein of unknown function DUF404  54.47 
 
 
508 aa  472  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.325623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  49.58 
 
 
477 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2484  protein of unknown function DUF404  53.77 
 
 
479 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2474  hypothetical protein  53.16 
 
 
515 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813576  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2208  hypothetical protein  53.77 
 
 
479 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  51.26 
 
 
476 aa  474  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  50.75 
 
 
469 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  53.77 
 
 
479 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  48.95 
 
 
481 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  51.18 
 
 
492 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2415  hypothetical protein  55.17 
 
 
463 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2676  hypothetical protein  52.54 
 
 
475 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.508929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  50.32 
 
 
469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  51.5 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  54.61 
 
 
472 aa  468  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  47.72 
 
 
482 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  50.54 
 
 
469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1078  hypothetical protein  55.17 
 
 
472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3052  hypothetical protein  51.52 
 
 
482 aa  468  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  50.21 
 
 
477 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4482  hypothetical protein  50.21 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0823  hypothetical protein  55.63 
 
 
470 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  49.89 
 
 
479 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  49.68 
 
 
488 aa  463  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.475477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>