236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1032 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  1005    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  66.18 
 
 
480 aa  676    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  66.03 
 
 
480 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  63.02 
 
 
501 aa  637    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  65.97 
 
 
480 aa  668    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  72.33 
 
 
477 aa  729    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  61.52 
 
 
476 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  59.83 
 
 
482 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  60.62 
 
 
489 aa  595  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  58.25 
 
 
482 aa  584  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  58.16 
 
 
486 aa  585  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  58.04 
 
 
482 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  58.99 
 
 
501 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1676  protein of unknown function DUF404  58.16 
 
 
482 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  58.4 
 
 
476 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  57.41 
 
 
482 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  57.2 
 
 
482 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  59.41 
 
 
480 aa  574  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  58.19 
 
 
476 aa  568  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0990  hypothetical protein  56.93 
 
 
484 aa  565  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  55.74 
 
 
482 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  55.32 
 
 
482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  59.49 
 
 
488 aa  561  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  55.35 
 
 
481 aa  555  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  57.38 
 
 
488 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11421  hypothetical protein  56.09 
 
 
480 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11431  hypothetical protein  55.67 
 
 
480 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2905  hypothetical protein  57.41 
 
 
487 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2264  hypothetical protein  56.67 
 
 
502 aa  545  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1049  hypothetical protein  55.46 
 
 
480 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2522  protein of unknown function DUF404  57.41 
 
 
487 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  56.39 
 
 
482 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2636  hypothetical protein  55.72 
 
 
499 aa  538  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  55.11 
 
 
488 aa  534  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  54.75 
 
 
507 aa  532  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  54.8 
 
 
487 aa  525  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  54.82 
 
 
473 aa  524  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  54.47 
 
 
492 aa  524  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  54.76 
 
 
478 aa  522  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0733  hypothetical protein  52.62 
 
 
476 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.195741  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  57.4 
 
 
494 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  57.4 
 
 
494 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15711  hypothetical protein  52.93 
 
 
477 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.144096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  53.18 
 
 
507 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  54.53 
 
 
471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  53.32 
 
 
469 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  54.06 
 
 
479 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  52.89 
 
 
469 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  53.1 
 
 
469 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  53.63 
 
 
479 aa  511  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  52 
 
 
481 aa  512  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  55.34 
 
 
470 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  53.38 
 
 
477 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  54.36 
 
 
497 aa  508  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  54.06 
 
 
489 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  53.56 
 
 
491 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  53.75 
 
 
469 aa  510  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  52.08 
 
 
488 aa  511  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  52.89 
 
 
469 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0404  hypothetical protein  53.32 
 
 
485 aa  511  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  54.91 
 
 
470 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  54.85 
 
 
497 aa  507  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  52.9 
 
 
471 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  53.21 
 
 
472 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  53.12 
 
 
469 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  51.94 
 
 
498 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  53.55 
 
 
469 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  52.74 
 
 
482 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  54.58 
 
 
476 aa  508  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1312  protein of unknown function DUF404  52.25 
 
 
480 aa  504  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  53.55 
 
 
469 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  52.24 
 
 
518 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  52.62 
 
 
518 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  56.57 
 
 
490 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  52.99 
 
 
472 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  53.63 
 
 
472 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  53.43 
 
 
469 aa  502  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  53.21 
 
 
472 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  52.52 
 
 
479 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  52.68 
 
 
469 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2484  protein of unknown function DUF404  52.71 
 
 
479 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2474  hypothetical protein  54.59 
 
 
515 aa  500  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813576  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  55.58 
 
 
486 aa  500  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  52.48 
 
 
479 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  52.03 
 
 
470 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0823  hypothetical protein  53.21 
 
 
470 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2208  hypothetical protein  52.71 
 
 
479 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  52.46 
 
 
469 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  55.33 
 
 
487 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  52.46 
 
 
494 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  52.13 
 
 
470 aa  496  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  55.46 
 
 
489 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0399  hypothetical protein  52.41 
 
 
484 aa  496  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  54.61 
 
 
479 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1078  hypothetical protein  51.92 
 
 
472 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  55.22 
 
 
464 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4002  hypothetical protein  50.21 
 
 
471 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  50.84 
 
 
490 aa  494  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  55.11 
 
 
487 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  53.03 
 
 
479 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>